More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2289 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  100 
 
 		 221 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  64.36 
 
 		 225 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  61.54 
 
 		 225 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  57.33 
 
 		 228 aa  274  9e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  57.33 
 
 		 228 aa  274  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  56.89 
 
 		 228 aa  271  7e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  56.4 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  55.34 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  56.59 
 
 		 214 aa  244  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  53.55 
 
 		 220 aa  239  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  55.88 
 
 		 214 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  54.15 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  51.18 
 
 		 216 aa  228  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  50.24 
 
 		 213 aa  214  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  51.43 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  52.2 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  51.44 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  52.4 
 
 		 214 aa  205  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  50.48 
 
 		 213 aa  204  6e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  48.82 
 
 		 215 aa  204  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  50 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  49.52 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  48.53 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  45.97 
 
 		 242 aa  191  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  45.18 
 
 		 210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  47.26 
 
 		 255 aa  175  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  43.14 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  46.31 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  43.43 
 
 		 210 aa  167  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  42.64 
 
 		 214 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  41.71 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  44.5 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  44.39 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  41.43 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  41.83 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1377  carbonic anhydrase  40.69 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0036  carbonate dehydratase  40.69 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  39.61 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  44.04 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0045  carbonate dehydratase  40.69 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  40.68 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  40.68 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  39.8 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  40 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  35.71 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  39.9 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  40.3 
 
 		 216 aa  147  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  38.54 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  44.26 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  38.54 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  36.63 
 
 		 213 aa  146  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  38.46 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  34.76 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  34.76 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  34.76 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  41.12 
 
 		 228 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  33.67 
 
 		 222 aa  141  8e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  40.7 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  40.7 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  40.31 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  36.36 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  38.94 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  34.83 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  36.19 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  39.5 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  37.75 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  39.58 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  35.78 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  33.68 
 
 		 210 aa  131  9e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  39.8 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  38.05 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  34.57 
 
 		 200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  33.96 
 
 		 217 aa  125  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  36.82 
 
 		 211 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  34.63 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  34.5 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  37.5 
 
 		 739 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  31.96 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  36.84 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  35.24 
 
 		 248 aa  118  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  34.78 
 
 		 211 aa  118  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  33.79 
 
 		 255 aa  117  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  34.2 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  35.78 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  35.78 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  36.15 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  33.17 
 
 		 239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 246 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  33.8 
 
 		 877 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  37.07 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  33.17 
 
 		 239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  34.65 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  34.65 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  33.82 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  34.47 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>