More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2276 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  76.82 
 
 
534 aa  815  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  79.78 
 
 
533 aa  859  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  80.15 
 
 
532 aa  848  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 
534 aa  1055  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  76.07 
 
 
534 aa  814  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  80.15 
 
 
532 aa  848  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  58.02 
 
 
531 aa  624  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  57.28 
 
 
532 aa  613  1e-174  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  54.04 
 
 
533 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  52.12 
 
 
533 aa  541  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  52.67 
 
 
532 aa  543  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  53.58 
 
 
533 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  53.02 
 
 
534 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  53.3 
 
 
856 aa  539  1e-152  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  53.66 
 
 
533 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  52.75 
 
 
533 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  51.65 
 
 
856 aa  517  1e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  51.37 
 
 
535 aa  513  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  48.35 
 
 
535 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.24 
 
 
853 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  46.18 
 
 
556 aa  447  1e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  48.53 
 
 
848 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  44.88 
 
 
554 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  47.3 
 
 
554 aa  430  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  45.81 
 
 
554 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  45.42 
 
 
554 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  48 
 
 
839 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  45.42 
 
 
554 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  48.33 
 
 
849 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  43.52 
 
 
554 aa  416  1e-115  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45.83 
 
 
844 aa  417  1e-115  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.39 
 
 
844 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.8 
 
 
845 aa  413  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.6 
 
 
844 aa  411  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  44.36 
 
 
531 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  40.55 
 
 
532 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  41.59 
 
 
535 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  41.65 
 
 
537 aa  389  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  41.2 
 
 
551 aa  382  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  41.88 
 
 
843 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.72 
 
 
834 aa  382  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.83 
 
 
846 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  41.44 
 
 
530 aa  360  4e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  40.31 
 
 
525 aa  357  3e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.55 
 
 
846 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  38.64 
 
 
533 aa  351  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  38.63 
 
 
532 aa  349  8e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  41 
 
 
632 aa  349  9e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  39.02 
 
 
532 aa  348  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  40.75 
 
 
530 aa  348  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  39.89 
 
 
533 aa  346  7e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.56259e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  39.73 
 
 
632 aa  345  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  39.53 
 
 
632 aa  343  3e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  37.68 
 
 
533 aa  336  6e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  40.94 
 
 
636 aa  334  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  39.56 
 
 
625 aa  329  9e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  38.17 
 
 
534 aa  328  2e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  38.82 
 
 
533 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  39.76 
 
 
640 aa  327  4e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  39.55 
 
 
594 aa  327  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  39.55 
 
 
594 aa  327  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  39.81 
 
 
533 aa  326  8e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  40.76 
 
 
524 aa  325  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  3.11445e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3866  preprotein translocase subunit SecD  39.8 
 
 
626 aa  325  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  38.26 
 
 
530 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0277  preprotein translocase subunit SecD  40.8 
 
 
626 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  39.45 
 
 
526 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  37.24 
 
 
501 aa  318  2e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0344  preprotein translocase subunit SecD  40.12 
 
 
633 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  37.35 
 
 
508 aa  317  3e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  38.45 
 
 
532 aa  314  3e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  36.47 
 
 
505 aa  312  1e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  40.32 
 
 
532 aa  311  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  40.08 
 
 
621 aa  312  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  37.36 
 
 
531 aa  312  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0627  protein-export membrane protein SecD  44.16 
 
 
502 aa  306  6e-82  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4645  preprotein translocase subunit SecD  38.83 
 
 
624 aa  306  7e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.48 
 
 
858 aa  306  7e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  39.44 
 
 
510 aa  305  2e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2715  preprotein translocase subunit SecD  38.35 
 
 
626 aa  303  4e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.177706 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  39.8 
 
 
604 aa  303  4e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5119  preprotein translocase subunit SecD  38.22 
 
 
627 aa  303  5e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  37.7 
 
 
512 aa  302  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1116  preprotein translocase subunit SecD  37.52 
 
 
624 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.818418  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  38.29 
 
 
609 aa  300  4e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  36.92 
 
 
533 aa  299  7e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  38.96 
 
 
621 aa  299  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1977  preprotein translocase subunit SecD  37.45 
 
 
618 aa  299  8e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  38.03 
 
 
529 aa  299  8e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  38.91 
 
 
521 aa  298  1e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1982  preprotein translocase subunit SecD  37.25 
 
 
618 aa  298  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  39.27 
 
 
521 aa  297  3e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3111  preprotein translocase subunit SecD  39.26 
 
 
616 aa  297  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2959  preprotein translocase subunit SecD  38.26 
 
 
629 aa  296  8e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  38.83 
 
 
623 aa  296  8e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  38.25 
 
 
526 aa  295  1e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2549  preprotein translocase subunit SecD  38.61 
 
 
629 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370381  normal  0.188242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  44.19 
 
 
399 aa  295  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3885  preprotein translocase subunit SecD  38.37 
 
 
625 aa  294  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527535  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1407  secretion protein SecD  35.34 
 
 
622 aa  292  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0970542  normal  0.495357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>