285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2275 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  76.58 
 
 
110 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  76.58 
 
 
110 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  72.07 
 
 
111 aa  160  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  78.02 
 
 
110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  72.97 
 
 
111 aa  140  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  60.95 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  60.95 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  66.67 
 
 
111 aa  123  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  59.62 
 
 
133 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  59.62 
 
 
110 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  60 
 
 
133 aa  121  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  56.73 
 
 
113 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  55.77 
 
 
113 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  60.38 
 
 
114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  55.77 
 
 
113 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  57.14 
 
 
143 aa  114  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  57.69 
 
 
146 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  63.46 
 
 
115 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  56.73 
 
 
142 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  58.82 
 
 
146 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  57.83 
 
 
93 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  54.84 
 
 
104 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  54.21 
 
 
115 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  49.51 
 
 
126 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  41.44 
 
 
123 aa  100  6e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  52.81 
 
 
94 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  51.22 
 
 
154 aa  96.7  9e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  48.62 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  54.32 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  53.95 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  54.32 
 
 
109 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  51.72 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  42.06 
 
 
106 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  51.72 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  51.14 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  42.2 
 
 
109 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  43.12 
 
 
107 aa  91.3  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  48.91 
 
 
123 aa  90.5  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  42.2 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  42.2 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  42.2 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  42.2 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  42.2 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  42.2 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 
110 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  40.71 
 
 
133 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  40.19 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  37.27 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  53.27 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  37.27 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  41.49 
 
 
127 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  45.35 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  45.35 
 
 
109 aa  85.5  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  39.45 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  37.27 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  39.45 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 
125 aa  84  6e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  38.18 
 
 
110 aa  83.6  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  39.45 
 
 
108 aa  83.6  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  40.37 
 
 
110 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  40.37 
 
 
110 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  36.04 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  48.24 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  43.3 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  37.84 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  44.32 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  38.53 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  47.5 
 
 
105 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  42.35 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  48.28 
 
 
117 aa  82  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  47.5 
 
 
106 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  41.49 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  40.23 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  43.02 
 
 
91 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  43.18 
 
 
94 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  43.02 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  43.69 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  43.69 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  43.69 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  43.69 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  43.69 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  43.69 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  43.69 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  43.69 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  40.7 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2434  preprotein translocase subunit YajC  46.84 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 
114 aa  80.1  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  41.86 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  41.86 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  41.86 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  41.86 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  41.86 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2213  preprotein translocase, YajC subunit  35.19 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00866418  normal  0.209417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>