113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1930 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1930  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 503 aa  948    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0490055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4742  peptidoglycan-binding LysM  44.61 
 
 		 511 aa  330  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5209  Peptidoglycan-binding LysM  44.69 
 
 		 511 aa  330  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.263437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1636  Peptidoglycan-binding LysM  40.53 
 
 		 451 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  37.56 
 
 		 405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0461  peptidoglycan-binding LysM  46.46 
 
 		 439 aa  191  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.520913  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  32.23 
 
 		 404 aa  159  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  32.13 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0972  peptidoglycan-binding LysM  31.12 
 
 		 546 aa  150  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0448  LysM domain-containing protein  31.71 
 
 		 404 aa  150  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1910  peptidoglycan-binding LysM  31.19 
 
 		 382 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2695  peptidoglycan-binding protein  31.84 
 
 		 440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1352  peptidoglycan-binding LysM  31.62 
 
 		 440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.47776  normal  0.0441198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5282  Peptidoglycan-binding LysM  81.36 
 
 		 552 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.772795 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1176  Peptidoglycan-binding LysM  31.67 
 
 		 676 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0861609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1869  peptidoglycan-binding LysM  34.87 
 
 		 367 aa  94.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1024  Peptidoglycan-binding LysM  30.53 
 
 		 680 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  31.94 
 
 		 572 aa  94  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  28.68 
 
 		 339 aa  87.8  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1112  peptidoglycan-binding LysM  29.85 
 
 		 322 aa  87.8  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  29.61 
 
 		 651 aa  87.4  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2688  peptidoglycan-binding LysM  28.69 
 
 		 361 aa  82.8  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00047104  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  72.73 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  30.87 
 
 		 663 aa  74.3  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2193  peptidoglycan-binding LysM  28.37 
 
 		 521 aa  70.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  56.82 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1766  hypothetical protein  50 
 
 		 531 aa  62.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.905557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  42.59 
 
 		 154 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  42.59 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  56.41 
 
 		 1051 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2167  LysM domain/BON superfamily protein  44.68 
 
 		 156 aa  54.3  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.420767  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2427  LysM domain/BON superfamily protein  44.68 
 
 		 156 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2264  LysM domain/BON superfamily protein  44.68 
 
 		 156 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2304  LysM domain/BON superfamily protein  44.68 
 
 		 156 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  38.6 
 
 		 166 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  40.74 
 
 		 156 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  47.83 
 
 		 364 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  47.83 
 
 		 395 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.74 
 
 		 155 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2244  hypothetical protein  53.19 
 
 		 156 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  40.74 
 
 		 156 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  40.74 
 
 		 156 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3255  LysM domain/BON superfamily protein  42.86 
 
 		 157 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  40.74 
 
 		 162 aa  51.6  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  40.74 
 
 		 156 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  40.74 
 
 		 162 aa  51.6  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  45.65 
 
 		 390 aa  51.6  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  40.74 
 
 		 156 aa  51.6  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  46.81 
 
 		 166 aa  50.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  38.89 
 
 		 168 aa  50.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  47.83 
 
 		 394 aa  50.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  38.89 
 
 		 158 aa  51.2  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  44.23 
 
 		 387 aa  50.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  40.74 
 
 		 156 aa  50.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2211  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42.59 
 
 		 500 aa  50.1  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00497018  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0952  LysM domain/BON superfamily protein  46.81 
 
 		 167 aa  50.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954636  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1406  cation transport ATPase  42.59 
 
 		 1082 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  29.7 
 
 		 161 aa  49.3  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  43.48 
 
 		 349 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 153 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  31.43 
 
 		 546 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1039  LysM domain-containing protein  42.86 
 
 		 243 aa  47.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000199986  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8210  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1090 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  38.89 
 
 		 168 aa  47.4  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1818  LysM domain/BON superfamily protein  37.74 
 
 		 156 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  38.89 
 
 		 168 aa  47  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 163 aa  47  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2091  hypothetical protein  42.31 
 
 		 167 aa  47  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 388 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 1079 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3125  integral membrane protein  36.84 
 
 		 628 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.435846  hitchhiker  0.000875177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1790  LysM domain/BON superfamily protein  37.74 
 
 		 156 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2152  Peptidoglycan-binding LysM  44.19 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  32.1 
 
 		 343 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  40.43 
 
 		 158 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1611  peptidoglycan-binding LysM  28.77 
 
 		 334 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000139366  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  38.18 
 
 		 242 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  36 
 
 		 97 aa  45.8  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02521  hypothetical protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1018  Peptidoglycan-binding LysM  38.78 
 
 		 149 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  44 
 
 		 190 aa  45.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0409  peptidoglycan-binding LysM  33.85 
 
 		 1385 aa  45.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.617719 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2945  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02485  hypothetical protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0283  LysM domain/BON superfamily protein  38.6 
 
 		 146 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1041  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  40.74 
 
 		 1910 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3216  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3907  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.979345  normal  0.391605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  40.43 
 
 		 161 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 149 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  40.43 
 
 		 161 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  38 
 
 		 358 aa  44.3  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  37.04 
 
 		 145 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2836  LysM domain/BON superfamily protein  38.3 
 
 		 148 aa  44.3  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 		 401 aa  44.3  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 318 aa  44.3  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  37.04 
 
 		 145 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>