More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1890 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
299 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  80.69 
 
 
300 aa  494  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  80.13 
 
 
296 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  80.62 
 
 
300 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  79.46 
 
 
296 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  79.12 
 
 
296 aa  490  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  71.33 
 
 
299 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  69.42 
 
 
296 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  71.82 
 
 
296 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  67.13 
 
 
291 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  66.32 
 
 
293 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  71.13 
 
 
296 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  69.76 
 
 
296 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  65.98 
 
 
293 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  65.98 
 
 
293 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  69.42 
 
 
296 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  62.54 
 
 
298 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  69.28 
 
 
319 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  69.07 
 
 
296 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  66.67 
 
 
293 aa  394  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  64.71 
 
 
290 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  68.04 
 
 
297 aa  384  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  61.17 
 
 
294 aa  382  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  64.36 
 
 
295 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  64.36 
 
 
290 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  66.78 
 
 
294 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  63.7 
 
 
294 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  60.9 
 
 
297 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  65.07 
 
 
294 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  65.86 
 
 
294 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  62.54 
 
 
293 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  61.59 
 
 
291 aa  364  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  64.83 
 
 
291 aa  364  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  61.25 
 
 
291 aa  360  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  61.72 
 
 
292 aa  351  8e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0150  dihydrodipicolinate synthase  61.25 
 
 
299 aa  338  4e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.613999  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  57.04 
 
 
293 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  54.08 
 
 
326 aa  322  7e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  55.36 
 
 
293 aa  319  3.9999999999999996e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  52.74 
 
 
296 aa  317  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  51.72 
 
 
291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  52.26 
 
 
290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0517  dihydrodipicolinate synthase  56.32 
 
 
292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 
300 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 
292 aa  289  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 
300 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 
300 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 
300 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 
300 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
292 aa  288  8e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 
300 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 
300 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 
300 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  50.88 
 
 
292 aa  285  9e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  49.15 
 
 
301 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  49.15 
 
 
301 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  49.49 
 
 
301 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  49.15 
 
 
301 aa  278  9e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
292 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 
296 aa  276  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 
292 aa  276  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  48.81 
 
 
300 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  48.79 
 
 
292 aa  275  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  48.81 
 
 
300 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  48.81 
 
 
300 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 
302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  47.65 
 
 
298 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 
298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 
298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 
292 aa  272  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  48.18 
 
 
292 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  46.39 
 
 
294 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  48.96 
 
 
297 aa  272  6e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  45.97 
 
 
297 aa  271  9e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
295 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
295 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
293 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 
295 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  44.93 
 
 
296 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 
292 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 
294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  45.33 
 
 
290 aa  269  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  48.15 
 
 
302 aa  269  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 
294 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
321 aa  269  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 
291 aa  269  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 
292 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 
292 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 
292 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 
292 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  47.32 
 
 
299 aa  268  8e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  47.32 
 
 
299 aa  268  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  46.08 
 
 
320 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  47.25 
 
 
290 aa  267  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 
292 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  47.25 
 
 
290 aa  267  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 
293 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  45.67 
 
 
290 aa  267  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  46.71 
 
 
292 aa  266  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 
291 aa  266  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>