More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1868 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  53.22 
 
 		 616 aa  638    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  100 
 
 		 638 aa  1229    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 		 626 aa  644    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  57.1 
 
 		 615 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  56.27 
 
 		 619 aa  663    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  56.65 
 
 		 623 aa  625  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  51.49 
 
 		 611 aa  614  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  57.12 
 
 		 618 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  56.46 
 
 		 618 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  56.46 
 
 		 618 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  56.03 
 
 		 615 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  43.56 
 
 		 623 aa  476  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  43.31 
 
 		 625 aa  459  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  41.56 
 
 		 625 aa  442  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 609 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  40.21 
 
 		 604 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  40.75 
 
 		 621 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  41.63 
 
 		 621 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 		 621 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  42.29 
 
 		 603 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  36.14 
 
 		 611 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.73 
 
 		 603 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  42.21 
 
 		 625 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  33.84 
 
 		 592 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  35.81 
 
 		 614 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  38.29 
 
 		 618 aa  346  8.999999999999999e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  39.41 
 
 		 605 aa  333  5e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.56 
 
 		 600 aa  331  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  35.05 
 
 		 613 aa  330  7e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  37.33 
 
 		 613 aa  324  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 608 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  36.38 
 
 		 606 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  37.41 
 
 		 621 aa  293  8e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  36.24 
 
 		 626 aa  277  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.58 
 
 		 633 aa  276  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  40.17 
 
 		 599 aa  272  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  30.1 
 
 		 566 aa  270  5e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  35.75 
 
 		 626 aa  269  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  36.41 
 
 		 608 aa  268  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  35.83 
 
 		 616 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  38.88 
 
 		 578 aa  265  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  33.87 
 
 		 619 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  34.88 
 
 		 616 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  32.01 
 
 		 611 aa  253  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  36.1 
 
 		 662 aa  249  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  27.81 
 
 		 605 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  35.87 
 
 		 627 aa  247  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  34.43 
 
 		 631 aa  246  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  27.49 
 
 		 597 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  36.15 
 
 		 673 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  26.4 
 
 		 603 aa  240  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  27.04 
 
 		 603 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  26.6 
 
 		 608 aa  238  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  35.98 
 
 		 623 aa  238  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  34.38 
 
 		 633 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  30.24 
 
 		 594 aa  234  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  36.08 
 
 		 665 aa  233  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  33.94 
 
 		 595 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.04 
 
 		 587 aa  231  4e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  33.74 
 
 		 626 aa  230  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  38.8 
 
 		 500 aa  229  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  30.37 
 
 		 653 aa  226  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.8 
 
 		 639 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  27.24 
 
 		 606 aa  226  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 		 596 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 		 596 aa  224  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.86 
 
 		 618 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  42.86 
 
 		 618 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  28.86 
 
 		 618 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  42.69 
 
 		 622 aa  221  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.64 
 
 		 641 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.45 
 
 		 632 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  44.17 
 
 		 604 aa  219  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  43.27 
 
 		 634 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  38.16 
 
 		 590 aa  217  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  33.04 
 
 		 624 aa  216  7e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 		 619 aa  216  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  28.18 
 
 		 604 aa  216  9e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  28.75 
 
 		 619 aa  216  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  36.8 
 
 		 586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.46 
 
 		 614 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.16 
 
 		 616 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 611 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  34.81 
 
 		 584 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.43 
 
 		 606 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  41.99 
 
 		 600 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.06 
 
 		 596 aa  212  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.71 
 
 		 586 aa  210  6e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  29.19 
 
 		 611 aa  210  7e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2823  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 585 aa  210  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0730  ABC transporter related  37.07 
 
 		 579 aa  208  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264899  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  29.92 
 
 		 610 aa  208  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  33.98 
 
 		 647 aa  208  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  28.48 
 
 		 619 aa  207  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.91 
 
 		 627 aa  207  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1839  ABC transporter related protein  39.42 
 
 		 590 aa  207  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298926  normal  0.0982891 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.41 
 
 		 583 aa  206  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  41.87 
 
 		 599 aa  206  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  34.77 
 
 		 626 aa  206  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.17 
 
 		 619 aa  205  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>