More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1809 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  100 
 
 
414 aa  774    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  48.15 
 
 
391 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  47.39 
 
 
392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  47.96 
 
 
382 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  47.19 
 
 
415 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  45.16 
 
 
392 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  40.34 
 
 
457 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  39.86 
 
 
459 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  39.04 
 
 
456 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  37.71 
 
 
455 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  39.18 
 
 
455 aa  242  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  39.9 
 
 
454 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  39 
 
 
453 aa  240  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  34.87 
 
 
430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  34.19 
 
 
439 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  35.96 
 
 
442 aa  193  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  33.49 
 
 
440 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  34.04 
 
 
450 aa  186  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  31.78 
 
 
459 aa  156  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  39.88 
 
 
402 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  42.99 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  30.05 
 
 
423 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  50.32 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  43.27 
 
 
460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  32.87 
 
 
446 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  38.43 
 
 
413 aa  144  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  41.63 
 
 
340 aa  143  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  48.08 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  33.26 
 
 
447 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  33.26 
 
 
447 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  46.75 
 
 
233 aa  136  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  38.84 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  45.26 
 
 
309 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  36.91 
 
 
491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  43.56 
 
 
302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  40.95 
 
 
288 aa  131  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  49.25 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  47.76 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  47.76 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  47.76 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  46.75 
 
 
290 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  46.15 
 
 
316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  55.26 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  56.78 
 
 
243 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  39.89 
 
 
442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  39.02 
 
 
318 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  41.12 
 
 
387 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  43.75 
 
 
303 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  49.61 
 
 
328 aa  126  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  42.68 
 
 
238 aa  126  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  33.97 
 
 
325 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.44 
 
 
321 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  48.23 
 
 
313 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  38.71 
 
 
445 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  52.89 
 
 
332 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  52.21 
 
 
332 aa  124  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  53.51 
 
 
328 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  40.76 
 
 
325 aa  122  8e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  54.24 
 
 
238 aa  123  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  49.58 
 
 
441 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  47.74 
 
 
293 aa  122  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  30.29 
 
 
301 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  42.66 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  48.2 
 
 
319 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  47.29 
 
 
330 aa  121  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  33.73 
 
 
301 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  48.74 
 
 
431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  53.39 
 
 
238 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  46.03 
 
 
482 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  31.34 
 
 
443 aa  119  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  42.28 
 
 
314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  46.4 
 
 
299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  46.88 
 
 
313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  48.41 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  39.74 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  35.41 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  37.27 
 
 
282 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  45.93 
 
 
430 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  44.72 
 
 
379 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  42.45 
 
 
343 aa  116  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  45.93 
 
 
448 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  43.07 
 
 
323 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  48.28 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  48.28 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  48.28 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  44.44 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  47.69 
 
 
538 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  48.28 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  49.59 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  45.9 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  48.28 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  44.36 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  50.43 
 
 
445 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  42.14 
 
 
327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  46.09 
 
 
524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  41.8 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  45.97 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  46.34 
 
 
398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  44.36 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  44.36 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>