277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1768 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  358  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  52.78 
 
 		 187 aa  187  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  56.73 
 
 		 181 aa  182  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  52.25 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 197 aa  165  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  43.86 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  50.29 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  43.86 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 206 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 206 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 178 aa  160  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  50.97 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 184 aa  154  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 203 aa  150  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  40.91 
 
 		 193 aa  127  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  34.48 
 
 		 189 aa  85.1  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  34.1 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  35.29 
 
 		 186 aa  72  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 186 aa  72  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 221 aa  67.4  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  37.09 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 415 aa  62  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 414 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4528  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 240 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 227 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  37.14 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  27.17 
 
 		 197 aa  52.4  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 230 aa  51.6  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2806  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00749048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 208 aa  51.2  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1574  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 435 aa  51.2  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 208 aa  50.8  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 224 aa  50.8  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 218 aa  50.8  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  31.15 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 248 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  29.69 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 238 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 234 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  28.88 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 234 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  27.52 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  27.52 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>