More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1650 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 349 aa  707    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  89.97 
 
 		 349 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  91.43 
 
 		 350 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  91.95 
 
 		 349 aa  662    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  91.67 
 
 		 349 aa  661    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  91.95 
 
 		 349 aa  662    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  77.3 
 
 		 346 aa  578  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  72.62 
 
 		 371 aa  535  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  72.91 
 
 		 349 aa  524  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  69.65 
 
 		 350 aa  514  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  69.74 
 
 		 347 aa  509  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  70.03 
 
 		 347 aa  510  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  66.76 
 
 		 351 aa  486  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  64 
 
 		 363 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  62.09 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  41.69 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  40.81 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  37.83 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  38.05 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  38.46 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  38.05 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  39.46 
 
 		 379 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  37.66 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  37.42 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  39.16 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  38.34 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  37.42 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  37.96 
 
 		 318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  37.74 
 
 		 324 aa  195  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  37.74 
 
 		 324 aa  195  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  39.48 
 
 		 325 aa  195  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  37.85 
 
 		 318 aa  193  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  37.85 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  38.06 
 
 		 310 aa  185  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  36.25 
 
 		 316 aa  175  8e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  33.12 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  35.54 
 
 		 303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  38.01 
 
 		 282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  35.69 
 
 		 313 aa  155  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  33.64 
 
 		 316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  33.97 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  36.84 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  33.02 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  34.08 
 
 		 312 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  34.21 
 
 		 321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  33.12 
 
 		 313 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  33.76 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  33.76 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  35.78 
 
 		 318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  33.33 
 
 		 338 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  35.09 
 
 		 318 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  35.62 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  35.62 
 
 		 327 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  35.62 
 
 		 327 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  34.39 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  34.59 
 
 		 304 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  34.84 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  32.14 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  29.55 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.04 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  29.39 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  30.31 
 
 		 292 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  30.31 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  32.75 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  27.3 
 
 		 284 aa  113  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  30.42 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  31.06 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  34.11 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  30.5 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  28.1 
 
 		 306 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  29.02 
 
 		 282 aa  103  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  29.43 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  29.89 
 
 		 274 aa  99.8  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  26.52 
 
 		 289 aa  99  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  29.23 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  31.12 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1285  citryl-CoA lyase  28.92 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  27.56 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.57 
 
 		 280 aa  97.8  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  30.24 
 
 		 296 aa  97.1  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  29.11 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  28.53 
 
 		 306 aa  96.7  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  29.52 
 
 		 306 aa  96.7  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  27.83 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  28.77 
 
 		 280 aa  96.3  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  27.83 
 
 		 305 aa  96.3  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.77 
 
 		 280 aa  96.3  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  30.1 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3048  Citryl-CoA lyase  27.78 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  29.11 
 
 		 291 aa  93.2  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  28.34 
 
 		 285 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  25.66 
 
 		 269 aa  92  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  28.03 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  28.48 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2984  HpcH/HpaI aldolase  29.46 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  31.56 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  26.9 
 
 		 286 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  31.25 
 
 		 296 aa  90.1  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  30.06 
 
 		 292 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>