More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1609 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  74.27 
 
 		 225 aa  279  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  47.85 
 
 		 231 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3455  transcriptional regulator, TetR family  45.03 
 
 		 245 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 540 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  38.21 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 211 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 210 aa  85.1  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  32.81 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  29.69 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  28.23 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  37.34 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 218 aa  72  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  35.56 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  34.59 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  28.06 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
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NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
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NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
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NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
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NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  25.58 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009427  Saro_3644  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
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NC_009670  Oant_4809  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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