More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1518 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  72.97 
 
 		 494 aa  699    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  73.76 
 
 		 488 aa  708    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  73.76 
 
 		 488 aa  708    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  100 
 
 		 504 aa  1009    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  72.71 
 
 		 471 aa  661    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  73.38 
 
 		 471 aa  662    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  54.95 
 
 		 480 aa  480  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  56.82 
 
 		 496 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  51.44 
 
 		 464 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  51.26 
 
 		 463 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  51.68 
 
 		 468 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  54.04 
 
 		 496 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  51.77 
 
 		 463 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  54.48 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  55.07 
 
 		 476 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  51.33 
 
 		 467 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  50.52 
 
 		 485 aa  438  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  48.19 
 
 		 476 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  47.54 
 
 		 474 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  47.54 
 
 		 474 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  45.92 
 
 		 465 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  43.33 
 
 		 467 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  44.16 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  45.19 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  46.49 
 
 		 492 aa  388  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  46.06 
 
 		 485 aa  382  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  47.8 
 
 		 491 aa  363  3e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  43.51 
 
 		 464 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1649  protease Do  47.62 
 
 		 474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  42.51 
 
 		 461 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  42.51 
 
 		 461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  42.6 
 
 		 461 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0287  peptidase S1C, Do  39.18 
 
 		 465 aa  319  9e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  44.47 
 
 		 511 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  39.29 
 
 		 476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  37.53 
 
 		 472 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.3 
 
 		 457 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  41.31 
 
 		 446 aa  279  7e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  39.18 
 
 		 450 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  38.57 
 
 		 450 aa  276  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  38.98 
 
 		 450 aa  276  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  42.09 
 
 		 449 aa  276  5e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  38.98 
 
 		 450 aa  276  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  41.3 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  38.41 
 
 		 479 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  39.81 
 
 		 458 aa  273  6e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  49.19 
 
 		 398 aa  272  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  40.12 
 
 		 450 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  39.57 
 
 		 478 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  40.43 
 
 		 504 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  38.37 
 
 		 450 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  40.5 
 
 		 483 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  40.27 
 
 		 483 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  40.58 
 
 		 458 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  38.48 
 
 		 506 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  38.16 
 
 		 450 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  40.62 
 
 		 502 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  33.99 
 
 		 497 aa  270  7e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  38.9 
 
 		 462 aa  269  7e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  38.16 
 
 		 450 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  38.16 
 
 		 450 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  41.89 
 
 		 450 aa  269  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  38.39 
 
 		 449 aa  269  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  40 
 
 		 502 aa  268  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  49.83 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  40.49 
 
 		 455 aa  266  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  39.48 
 
 		 469 aa  266  8e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.32 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  34.61 
 
 		 471 aa  265  1e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  37.11 
 
 		 496 aa  265  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  49.5 
 
 		 404 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.82 
 
 		 398 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.22 
 
 		 412 aa  264  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  42.58 
 
 		 460 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  40.1 
 
 		 505 aa  263  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  48.64 
 
 		 407 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  50 
 
 		 385 aa  263  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  37.91 
 
 		 451 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  39.14 
 
 		 491 aa  263  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  39.67 
 
 		 501 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  41.44 
 
 		 471 aa  262  8e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  34.93 
 
 		 503 aa  262  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  37.37 
 
 		 508 aa  262  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  37.55 
 
 		 451 aa  262  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  38.18 
 
 		 513 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  49.16 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  43.52 
 
 		 458 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  43.48 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  46.67 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  38.41 
 
 		 473 aa  260  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  48.65 
 
 		 407 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  39.96 
 
 		 475 aa  259  7e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.13 
 
 		 390 aa  259  7e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.46 
 
 		 385 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  39.13 
 
 		 518 aa  259  9e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  40.74 
 
 		 483 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  37.61 
 
 		 456 aa  259  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  40 
 
 		 455 aa  259  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  39.6 
 
 		 457 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  44.59 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>