121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1510 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  47.45 
 
 		 155 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  54.61 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  59.7 
 
 		 163 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  59.7 
 
 		 172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  44.53 
 
 		 157 aa  118  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 120 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 145 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  55 
 
 		 151 aa  105  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 148 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 148 aa  98.6  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 161 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  54.74 
 
 		 147 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  44.78 
 
 		 148 aa  95.9  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  47 
 
 		 189 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 143 aa  94  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 		 182 aa  91.7  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 155 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  45.95 
 
 		 151 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  43.51 
 
 		 147 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 144 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  32.98 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 175 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 170 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  52  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  26.7 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  32.08 
 
 		 154 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 167 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 146 aa  49.3  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3341  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 158 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 152 aa  48.9  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 163 aa  48.5  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0283  hypothetical protein  26.09 
 
 		 151 aa  48.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000125013  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 141 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1036  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 85 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0755699  normal  0.33215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18960  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0870752  normal  0.777873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 157 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 148 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 161 aa  45.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3588  transcriptional regulator, MarR family  22.52 
 
 		 151 aa  45.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 167 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 164 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26770  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 143 aa  45.1  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 147 aa  45.1  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  26.5 
 
 		 155 aa  44.7  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  27.82 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  33.75 
 
 		 135 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 150 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 168 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  21.1 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  30.77 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  37.78 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 138 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 155 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  32 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  22.34 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2642  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 143 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  29.17 
 
 		 283 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 170 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 171 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>