More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1146 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1146  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
173 aa  328  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0306  hypothetical protein  68.24 
 
 
173 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6468  hypothetical protein  67.06 
 
 
173 aa  233  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.379701  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2896  hypothetical protein  63.95 
 
 
173 aa  216  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0774242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2669  hypothetical protein  63.95 
 
 
173 aa  216  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.618552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2791  hypothetical protein  62.79 
 
 
173 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1430  hypothetical protein  62.21 
 
 
173 aa  198  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1058  hypothetical protein  62.79 
 
 
173 aa  197  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  50.94 
 
 
176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3203  SNARE associated Golgi protein  53.33 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.473398  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  48.48 
 
 
176 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  47.13 
 
 
176 aa  143  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  50 
 
 
176 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  47.13 
 
 
176 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  49.13 
 
 
176 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0269  DedA family protein  51.45 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.867407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3643  hypothetical protein  51.45 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3947  hypothetical protein  51.45 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  45.06 
 
 
220 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  47.53 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  44.44 
 
 
220 aa  134  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  50 
 
 
176 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  45.06 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  37.65 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.68 
 
 
664 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.04 
 
 
664 aa  114  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  37.04 
 
 
241 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  36.97 
 
 
239 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  32.89 
 
 
678 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  32.89 
 
 
678 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  37.01 
 
 
255 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  37.01 
 
 
255 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  37.01 
 
 
255 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.31 
 
 
676 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1821  uncharacterized membrane-associated protein  37.42 
 
 
179 aa  97.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.274709 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0188  hypothetical protein  36.77 
 
 
179 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0587064  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  36.81 
 
 
256 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  38.41 
 
 
677 aa  95.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1457  hypothetical protein  36.13 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  35.62 
 
 
695 aa  93.6  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  32.72 
 
 
682 aa  91.7  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  32.72 
 
 
682 aa  91.7  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  90.9  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  38.46 
 
 
211 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  35.77 
 
 
255 aa  90.1  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  35.77 
 
 
256 aa  89.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  40.41 
 
 
686 aa  89.4  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  35.93 
 
 
218 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.95 
 
 
668 aa  88.6  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  33.95 
 
 
681 aa  87.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  33.33 
 
 
254 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  87.4  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
254 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.68 
 
 
254 aa  87  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  37.09 
 
 
438 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.42 
 
 
438 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  34.31 
 
 
255 aa  85.5  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.1 
 
 
671 aa  84.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  34.76 
 
 
641 aa  84.7  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.04 
 
 
256 aa  84.7  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.31 
 
 
483 aa  84.7  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  34.06 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  34.06 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.45 
 
 
438 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  34.06 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  34.06 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  34.06 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  38.97 
 
 
672 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.12 
 
 
684 aa  82.8  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  40.44 
 
 
672 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.85 
 
 
662 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 
205 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  32.48 
 
 
684 aa  80.9  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.06 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  33.97 
 
 
439 aa  79  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4213  SNARE associated Golgi protein  35.94 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209059  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3600  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  33.97 
 
 
438 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3501  DedA family membrane protein  38.97 
 
 
672 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0300275 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0340  SNARE associated Golgi protein  33.59 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0383  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.59 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  32.03 
 
 
437 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0026  DedA family protein  32.62 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  31.37 
 
 
437 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.4 
 
 
664 aa  72  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3583  inner membrane protein YqjA  30.88 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0452465  normal  0.251546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  36.26 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3417  inner membrane protein YqjA  30.88 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3763  SNARE associated Golgi protein  31.45 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3487  inner membrane protein YqjA  30.88 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3388  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
224 aa  71.2  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0526  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
227 aa  70.9  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4325  SNARE associated Golgi protein  30.22 
 
 
223 aa  70.9  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  30.77 
 
 
438 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0487  hypothetical protein  30.88 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000202069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>