168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1083 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
212 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2795  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  67.11 
 
 
214 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2919  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  66.06 
 
 
210 aa  211  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3023  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  65.79 
 
 
214 aa  208  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00777053  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3630  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  60.49 
 
 
211 aa  201  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5913  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  72.73 
 
 
209 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1237  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.75 
 
 
184 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0082  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.25 
 
 
368 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0164  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.04 
 
 
219 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1842  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.55 
 
 
183 aa  168  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0087761  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6152  hypothetical protein  51.18 
 
 
264 aa  165  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  0.0289624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3373  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.37 
 
 
270 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  hitchhiker  0.00517308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2743  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.7 
 
 
269 aa  159  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2364  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  53.5 
 
 
270 aa  158  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0212469  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4027  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.68 
 
 
260 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3286  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  54.17 
 
 
251 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0799688  normal  0.416162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  54.17 
 
 
253 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1444  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.25 
 
 
168 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1788  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.62 
 
 
190 aa  118  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2361  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.97 
 
 
142 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0110232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.8 
 
 
142 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1314  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50 
 
 
139 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  46.43 
 
 
408 aa  68.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  36.07 
 
 
330 aa  68.2  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0685  hypothetical protein  35.66 
 
 
293 aa  62.8  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645291  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21900  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.95 
 
 
263 aa  61.6  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.65 
 
 
171 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  35.71 
 
 
361 aa  59.7  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.9 
 
 
257 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  35.25 
 
 
411 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1729  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.87 
 
 
205 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  34.07 
 
 
519 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  39.6 
 
 
503 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  38.61 
 
 
520 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.53 
 
 
332 aa  57.4  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  41.24 
 
 
455 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.17 
 
 
307 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  31.75 
 
 
419 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  31.67 
 
 
418 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.33 
 
 
289 aa  54.7  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0668  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.47 
 
 
253 aa  55.1  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.91 
 
 
177 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  41.03 
 
 
496 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  37.62 
 
 
536 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0633  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.14 
 
 
253 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.96 
 
 
257 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0819  hypothetical protein  28.21 
 
 
253 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0913  hypothetical protein  28.21 
 
 
253 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.97 
 
 
315 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  30.25 
 
 
347 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  31.97 
 
 
568 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0578  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.24 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  30.25 
 
 
354 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.77 
 
 
309 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  33.62 
 
 
344 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4524  hypothetical protein  29.77 
 
 
253 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0816159 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0664  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.16 
 
 
253 aa  52  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0825  hypothetical protein  27.16 
 
 
253 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2602e-53 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.33 
 
 
216 aa  52  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0304  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.58 
 
 
168 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0656  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.56 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  30.95 
 
 
493 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2980  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.85 
 
 
300 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3070  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.24 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428129  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  31.11 
 
 
503 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0518  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.04 
 
 
309 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.77 
 
 
376 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.54 
 
 
370 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1290  hypothetical protein  33.61 
 
 
248 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.52 
 
 
170 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1577  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.69 
 
 
303 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000893286  normal  0.294184 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  29.75 
 
 
575 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.27 
 
 
192 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1319  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
142 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  32.99 
 
 
537 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1289  hypothetical protein  33.61 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21380  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.57 
 
 
181 aa  49.7  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0817  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.14 
 
 
295 aa  48.9  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000447964  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 
171 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1978  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.87 
 
 
223 aa  48.5  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23090  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.32 
 
 
317 aa  48.5  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00352469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1550  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
278 aa  48.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794871 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.08 
 
 
250 aa  48.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  30.93 
 
 
588 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  34.78 
 
 
520 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2689  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.02 
 
 
278 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287545  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.45 
 
 
345 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0905  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.07 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1285  enhanced entry protein EnhA  44.62 
 
 
245 aa  47.4  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00169403  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2287  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.26 
 
 
167 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000631193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4221  hypothetical protein  26.05 
 
 
186 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00480298  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3894  ErfK/SrfK protein  25.21 
 
 
186 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000648074  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0647  hypothetical protein  29.36 
 
 
180 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.02 
 
 
217 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.27 
 
 
247 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.55 
 
 
230 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000150825  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2556  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.93 
 
 
318 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000497106  hitchhiker  9.91148e-17 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1236  enhanced entry protein  44.62 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.58 
 
 
397 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4281  hypothetical protein  25.21 
 
 
186 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0049222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>