80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1047 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 313 aa  645    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  72.4 
 
 		 301 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  69.02 
 
 		 349 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  69.02 
 
 		 301 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  67.49 
 
 		 289 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  65.23 
 
 		 308 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  44.12 
 
 		 276 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  44.12 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  42.11 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  40.66 
 
 		 276 aa  208  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  39.93 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  38.52 
 
 		 278 aa  195  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  39.78 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  38.24 
 
 		 320 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  36.33 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  35.69 
 
 		 308 aa  179  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  34.42 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  32.01 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  35.48 
 
 		 285 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  35.48 
 
 		 285 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  34.51 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  35.06 
 
 		 296 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  35.61 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  29.97 
 
 		 284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  34.5 
 
 		 279 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  30.35 
 
 		 333 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  34.04 
 
 		 603 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  30.45 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  32.63 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  34.94 
 
 		 607 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  31.31 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 		 295 aa  129  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  32.68 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  31.27 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  26.67 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  30.59 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  29.59 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.79 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  26.52 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  26.26 
 
 		 301 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  28.36 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  31.23 
 
 		 320 aa  93.2  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.49 
 
 		 320 aa  92.4  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  28.09 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  24.75 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  32.78 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 		 270 aa  52.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  26.72 
 
 		 248 aa  52.8  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  22.3 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  26.82 
 
 		 253 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  34.52 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  29.36 
 
 		 393 aa  49.3  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  22.55 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  23.3 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  27.45 
 
 		 364 aa  47  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  31.82 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  23.05 
 
 		 304 aa  46.2  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  24.72 
 
 		 235 aa  46.2  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  31.38 
 
 		 238 aa  46.2  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  24.07 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  27.38 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  23.81 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  25.85 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  25.49 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0405  beta-lactamase domain-containing protein  23.49 
 
 		 287 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.945649  normal  0.820015 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 		 256 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  27.8 
 
 		 260 aa  42.7  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 263 aa  42.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  30.14 
 
 		 307 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  22.48 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  25.74 
 
 		 323 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>