More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1037 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  57.87 
 
 
558 aa  647    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  63.53 
 
 
552 aa  711    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  63.28 
 
 
545 aa  720    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  65.49 
 
 
554 aa  725    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  64.62 
 
 
535 aa  714    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  64.18 
 
 
540 aa  707    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  59.3 
 
 
548 aa  695    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  61.76 
 
 
563 aa  704    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  62.64 
 
 
563 aa  708    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4179  cytochrome c oxidase, subunit I  62.09 
 
 
557 aa  682    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  64.15 
 
 
544 aa  720    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6885  cytochrome c oxidase, subunit I  60.45 
 
 
558 aa  664    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 
558 aa  1113    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  62.27 
 
 
565 aa  693    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  62.78 
 
 
563 aa  709    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  55.56 
 
 
564 aa  600  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0849  cytochrome c oxidase subunit I type  55.79 
 
 
555 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  51.95 
 
 
556 aa  587  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0804  cytochrome-c oxidase  55.45 
 
 
554 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0852  cytochrome c oxidase, subunit I  55.08 
 
 
554 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0856  cytochrome c oxidase, subunit I  55.08 
 
 
554 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0230  cytochrome c oxidase, subunit I  55.87 
 
 
565 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123434  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  52.59 
 
 
542 aa  569  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2705  Cytochrome-c oxidase  57.31 
 
 
528 aa  567  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2274  cytochrome-c oxidase  54.11 
 
 
554 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.413145  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  51.06 
 
 
539 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1601  cytochrome c oxidase, subunit I  53.45 
 
 
555 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  52.7 
 
 
541 aa  533  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1677  cytochrome c oxidase, subunit I  53.27 
 
 
555 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  51.54 
 
 
541 aa  534  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  50.46 
 
 
539 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  50.68 
 
 
541 aa  524  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2526  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit I  53.19 
 
 
543 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000123308  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  51.06 
 
 
541 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  50.97 
 
 
542 aa  514  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1823  cytochrome-c oxidase  51.45 
 
 
543 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  45.24 
 
 
587 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  42.98 
 
 
560 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  43.75 
 
 
564 aa  439  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  44.76 
 
 
641 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  42.07 
 
 
555 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  43.26 
 
 
554 aa  438  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  41.79 
 
 
541 aa  437  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  42.07 
 
 
555 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  44.38 
 
 
641 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  42.61 
 
 
548 aa  433  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  44.21 
 
 
615 aa  435  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  42.26 
 
 
590 aa  433  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  44.47 
 
 
553 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  41.79 
 
 
556 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  42.4 
 
 
575 aa  425  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  42.48 
 
 
555 aa  427  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  42.23 
 
 
566 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  43.56 
 
 
796 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  42.57 
 
 
559 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  41.26 
 
 
552 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  40.87 
 
 
546 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  40.87 
 
 
546 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  41.32 
 
 
558 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  39.96 
 
 
541 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  41.43 
 
 
536 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  45.29 
 
 
806 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  40.98 
 
 
540 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  41.64 
 
 
559 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  42.81 
 
 
583 aa  413  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  39.78 
 
 
541 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  41.75 
 
 
539 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  40.15 
 
 
541 aa  415  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  42.19 
 
 
534 aa  411  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  42.19 
 
 
553 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  40.55 
 
 
546 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  41.3 
 
 
563 aa  409  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  42.77 
 
 
534 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  40.34 
 
 
611 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  41.33 
 
 
530 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  40.54 
 
 
620 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  40.73 
 
 
620 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  40.73 
 
 
620 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  40.73 
 
 
620 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  41.5 
 
 
620 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  41.81 
 
 
565 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  40.34 
 
 
620 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  42.29 
 
 
555 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  40.54 
 
 
611 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  40.73 
 
 
620 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  42.2 
 
 
661 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  43.52 
 
 
532 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  40.73 
 
 
620 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  40.96 
 
 
539 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  41.33 
 
 
530 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  41.52 
 
 
530 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  40.49 
 
 
619 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  41.52 
 
 
530 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  41.65 
 
 
544 aa  403  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  43.06 
 
 
609 aa  405  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  40.78 
 
 
543 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  41.59 
 
 
531 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  40.75 
 
 
543 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  41.03 
 
 
530 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  43.98 
 
 
567 aa  402  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>