More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1036 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
219 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  35.29 
 
 
226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  40.89 
 
 
215 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  37.5 
 
 
209 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  35.85 
 
 
229 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  34.13 
 
 
214 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  36.14 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  38.73 
 
 
225 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  35.39 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  42.36 
 
 
196 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  36.24 
 
 
235 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  37.5 
 
 
234 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  35.27 
 
 
211 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  38.14 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  33.98 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  33.98 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  33.98 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  35.51 
 
 
234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  35.51 
 
 
234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  37.67 
 
 
229 aa  124  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  37.13 
 
 
211 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  39.09 
 
 
215 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  38.94 
 
 
224 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  38.6 
 
 
229 aa  121  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  30 
 
 
262 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  37.75 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  33.17 
 
 
199 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  38.07 
 
 
198 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  38.27 
 
 
209 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  34.69 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  35.5 
 
 
199 aa  94.7  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  30.85 
 
 
208 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  32.83 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  32.64 
 
 
827 aa  89.7  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3991  cytochrome c oxidase subunit III  37.4 
 
 
305 aa  89.4  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.632363  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  35.35 
 
 
199 aa  89  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  29.11 
 
 
819 aa  84.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  29.77 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  30 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  33.16 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  28.57 
 
 
825 aa  82  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  30.61 
 
 
194 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  25.46 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  33.17 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  27.55 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  26.9 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  28.29 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  27.62 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  26.32 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  28.72 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  28.36 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  27.14 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  29.47 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  28.04 
 
 
832 aa  76.3  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  28.31 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  28.97 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  29.11 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  25.25 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  30.89 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  29.58 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  30.65 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  32.45 
 
 
184 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  27.23 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  29.95 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  26.09 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  27.18 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  26.36 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  28.87 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  26.7 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  26.76 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  27.8 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  28.3 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  25.45 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  27.62 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  26 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0222  cytochrome c oxidase, subunit III  29.38 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  27 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  27.48 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  29.1 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  29.1 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  25.24 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  24.5 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  27.46 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  26.43 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4220  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  25.4 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  25.13 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3860  cytochrome c oxidase, subunit III  25.4 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.516047  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  25.13 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  27.5 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  25.38 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  31.91 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  26.57 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  27.23 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4148  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  25.4 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>