More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1027 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 
459 aa  867    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0486  Fmu (Sun) domain protein  67.73 
 
 
454 aa  488  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0551  Fmu (Sun) domain-containing protein  67.37 
 
 
425 aa  474  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  66.82 
 
 
447 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0522  Fmu (Sun) domain protein  66.29 
 
 
438 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0621766  normal  0.207218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5220  sun protein  62.79 
 
 
448 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02946  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2071  sun protein  53.19 
 
 
463 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1424  sun protein  54.13 
 
 
448 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  52.69 
 
 
450 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  52.37 
 
 
450 aa  391  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  51.02 
 
 
450 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  52.15 
 
 
450 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  51.14 
 
 
450 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  51.12 
 
 
450 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  50.56 
 
 
450 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  54.01 
 
 
471 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  48.97 
 
 
460 aa  355  6.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.21 
 
 
470 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3917  Fmu (Sun) domain protein  48.76 
 
 
462 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0687458  normal  0.615707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  50.63 
 
 
460 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.19 
 
 
453 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  47.17 
 
 
465 aa  345  8e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  46.94 
 
 
465 aa  344  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  49.67 
 
 
493 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  51.69 
 
 
440 aa  328  9e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000516212 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  43.05 
 
 
456 aa  318  1e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  49.77 
 
 
438 aa  310  4e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.47 
 
 
426 aa  302  9e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  49.37 
 
 
443 aa  290  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.28 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.1 
 
 
535 aa  270  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  43.58 
 
 
410 aa  268  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.95 
 
 
422 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0089  Fmu (Sun)  51.91 
 
 
424 aa  254  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  44.62 
 
 
419 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  38.55 
 
 
452 aa  251  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2926  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.3 
 
 
422 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351382  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.25 
 
 
410 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  44.12 
 
 
437 aa  229  9e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  48.88 
 
 
438 aa  219  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2654  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.3 
 
 
415 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  33.01 
 
 
426 aa  201  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6147  rRNA methyltransferase RsmB-like  42.53 
 
 
421 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  32.21 
 
 
426 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  42.47 
 
 
451 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  32.75 
 
 
445 aa  195  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  36.12 
 
 
452 aa  195  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  32.93 
 
 
427 aa  192  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  32.77 
 
 
425 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  33.65 
 
 
428 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  32.26 
 
 
451 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  33.65 
 
 
428 aa  190  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  35.18 
 
 
439 aa  190  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  33.25 
 
 
436 aa  189  7e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  31.11 
 
 
443 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  36.03 
 
 
464 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0021  sun protein  37.95 
 
 
437 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  32.03 
 
 
462 aa  186  7e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  30.23 
 
 
446 aa  186  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  31.26 
 
 
451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  33.84 
 
 
427 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  33.74 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  31.25 
 
 
452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  31.03 
 
 
451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  32.23 
 
 
447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  33.59 
 
 
427 aa  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  30.23 
 
 
462 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  32.45 
 
 
429 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  35.42 
 
 
451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  35.14 
 
 
449 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.96 
 
 
449 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  34.45 
 
 
429 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  27.55 
 
 
444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  36.98 
 
 
448 aa  183  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  32.52 
 
 
429 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  34.13 
 
 
451 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  32.61 
 
 
444 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  34.23 
 
 
429 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  32.01 
 
 
440 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  33.62 
 
 
429 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  34.45 
 
 
429 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  32.04 
 
 
429 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  37.67 
 
 
418 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.398476  normal  0.248834 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1927  Sun protein  40.1 
 
 
429 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00150  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  39.04 
 
 
443 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  34.55 
 
 
452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  30.84 
 
 
428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  30.84 
 
 
429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  35.16 
 
 
434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1863  sun protein  39.85 
 
 
431 aa  181  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  34 
 
 
429 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  33.26 
 
 
429 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3405  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  39.33 
 
 
457 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  30.98 
 
 
428 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  29.05 
 
 
462 aa  179  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  33.33 
 
 
429 aa  179  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  33.33 
 
 
429 aa  179  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  33.33 
 
 
429 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  35.54 
 
 
429 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  31.71 
 
 
428 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>