More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0953 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  80.73 
 
 
438 aa  709    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  83.52 
 
 
456 aa  728    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  80.73 
 
 
438 aa  709    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
447 aa  895    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  73.29 
 
 
434 aa  668    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  80.91 
 
 
452 aa  706    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  80.91 
 
 
463 aa  706    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  80.73 
 
 
434 aa  711    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  81.19 
 
 
434 aa  714    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  71.17 
 
 
439 aa  643    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  79.82 
 
 
433 aa  702    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  81.65 
 
 
434 aa  722    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  82.11 
 
 
438 aa  721    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  79.64 
 
 
440 aa  718    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  73.06 
 
 
434 aa  664    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.77 
 
 
438 aa  657    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  69.5 
 
 
442 aa  633  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  69.5 
 
 
441 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.3 
 
 
437 aa  630  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.48 
 
 
439 aa  627  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.48 
 
 
434 aa  625  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.85 
 
 
438 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.25 
 
 
436 aa  627  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  71.4 
 
 
436 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  68.72 
 
 
435 aa  615  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.48 
 
 
436 aa  615  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.62 
 
 
435 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.71 
 
 
436 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  68.19 
 
 
433 aa  598  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.51 
 
 
433 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  68.11 
 
 
436 aa  594  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.72 
 
 
438 aa  589  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.53 
 
 
434 aa  563  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.27 
 
 
451 aa  549  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  61.36 
 
 
438 aa  549  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.19 
 
 
438 aa  548  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.19 
 
 
434 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.19 
 
 
434 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  59.68 
 
 
449 aa  534  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.9 
 
 
434 aa  532  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.87 
 
 
434 aa  529  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.68 
 
 
437 aa  527  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  60.5 
 
 
464 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  58.78 
 
 
441 aa  509  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.9 
 
 
478 aa  491  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.73 
 
 
453 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0476  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.9 
 
 
474 aa  485  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.10273  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0545  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.68 
 
 
474 aa  483  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1348  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.68 
 
 
460 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.05 
 
 
440 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.11 
 
 
443 aa  461  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1714  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.71 
 
 
436 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  54.77 
 
 
473 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.55 
 
 
467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.77 
 
 
438 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.66 
 
 
460 aa  450  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  47.19 
 
 
440 aa  433  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  49.55 
 
 
440 aa  429  1e-119  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  48.17 
 
 
437 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  49.33 
 
 
448 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  48.17 
 
 
437 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  50.44 
 
 
447 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.45 
 
 
436 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.47 
 
 
457 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  51.22 
 
 
436 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.76 
 
 
440 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.76 
 
 
440 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  49.77 
 
 
440 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  51.12 
 
 
435 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  50 
 
 
446 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.78 
 
 
457 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  46.07 
 
 
466 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3213  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.61 
 
 
503 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.25 
 
 
457 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  49.33 
 
 
443 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.77 
 
 
447 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  47.65 
 
 
442 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48 
 
 
446 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4070  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.1 
 
 
449 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476098  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  47.26 
 
 
443 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.55 
 
 
448 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  46.53 
 
 
427 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.12 
 
 
452 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  46.48 
 
 
450 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  49.89 
 
 
437 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  47.72 
 
 
466 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.99 
 
 
444 aa  408  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  48.42 
 
 
445 aa  409  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.88 
 
 
450 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  45.23 
 
 
435 aa  409  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  47.15 
 
 
482 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.81 
 
 
482 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.72 
 
 
466 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.51 
 
 
466 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.96 
 
 
445 aa  410  1e-113  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2782  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.43 
 
 
457 aa  408  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.72 
 
 
466 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.14 
 
 
438 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  48.08 
 
 
522 aa  406  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  48.14 
 
 
473 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>