More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0930 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0930  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 207 aa  410  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.811793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0962  Holliday junction resolvase  82.63 
 
 		 189 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00555421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0926  Holliday junction resolvase  82.63 
 
 		 189 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.66838  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0902  Holliday junction resolvase  82.04 
 
 		 189 aa  251  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0285  Holliday junction resolvase  77.02 
 
 		 189 aa  226  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2328  Holliday junction resolvase  78.21 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0343755  normal  0.15621 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  58.54 
 
 		 167 aa  190  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3512  Holliday junction resolvase  60.24 
 
 		 169 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658473  normal  0.710668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4806  Holliday junction resolvase  62.2 
 
 		 175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3523  Holliday junction resolvase  60.74 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3604  Holliday junction resolvase  59.64 
 
 		 169 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.758164  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3217  Holliday junction resolvase  58.43 
 
 		 169 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.571528 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2726  Holliday junction resolvase  58.9 
 
 		 172 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1211  Holliday junction resolvase  58.75 
 
 		 172 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1647  Holliday junction resolvase  58.75 
 
 		 173 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4170  Holliday junction resolvase  61.04 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6909  Holliday junction resolvase  60.62 
 
 		 175 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.293196 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2639  Holliday junction resolvase  58.43 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1704  Holliday junction resolvase  58.13 
 
 		 173 aa  171  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.723247  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1289  Holliday junction resolvase  62.42 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0002  Holliday junction resolvase  59.26 
 
 		 176 aa  167  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0004  Holliday junction resolvase  54.59 
 
 		 175 aa  166  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000281167  normal  0.194479 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.62 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4272  Holliday junction resolvase  60.26 
 
 		 198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0821163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  54.37 
 
 		 168 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0556  Holliday junction resolvase  56.86 
 
 		 168 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.657324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2208  Holliday junction resolvase  56.86 
 
 		 168 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147946  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3179  Holliday junction resolvase  56.63 
 
 		 171 aa  157  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0784  Holliday junction resolvase  55.7 
 
 		 169 aa  156  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193363  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.9 
 
 		 175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.335061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  51.01 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  47.37 
 
 		 164 aa  148  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1230  Holliday junction resolvase  58.82 
 
 		 168 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.45 
 
 		 158 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 164 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1103  Holliday junction resolvase  56.86 
 
 		 176 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.788041  normal  0.52984 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2373  Holliday junction resolvase  54.96 
 
 		 188 aa  141  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.511513 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  43.4 
 
 		 180 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  44.08 
 
 		 171 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1087  Holliday junction resolvase  54.55 
 
 		 169 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  44.59 
 
 		 164 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  45.64 
 
 		 164 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  48.34 
 
 		 173 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  48.34 
 
 		 161 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  47.1 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  46.45 
 
 		 181 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  44 
 
 		 176 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  42.21 
 
 		 162 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  47.68 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0964  Holliday junction resolvase  51.91 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.75 
 
 		 165 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  42.11 
 
 		 182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  45.7 
 
 		 181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.36 
 
 		 173 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.67 
 
 		 163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  45.03 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  44.97 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  45.03 
 
 		 181 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2906  Holliday junction resolvase  53.29 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  45.03 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2141  Holliday junction resolvase  47.5 
 
 		 165 aa  125  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.65 
 
 		 183 aa  124  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0142  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.5 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  39.24 
 
 		 166 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  44.97 
 
 		 173 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  48.39 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.16 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  47.37 
 
 		 180 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01556  Holliday junction resolvase  45.45 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 180 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  46.75 
 
 		 180 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  45.27 
 
 		 173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  45.27 
 
 		 173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2424  Holliday junction endonuclease RuvC  55.42 
 
 		 166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  46.75 
 
 		 180 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  46.75 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  46.75 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  45.81 
 
 		 182 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.13 
 
 		 164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  46.45 
 
 		 182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.06 
 
 		 174 aa  118  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.1 
 
 		 167 aa  118  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  46.1 
 
 		 183 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  43.92 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  43.23 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  46.1 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  46.1 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  45.64 
 
 		 173 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  43.51 
 
 		 173 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  40.12 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  45.64 
 
 		 173 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  45.64 
 
 		 173 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  46.1 
 
 		 184 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  44.59 
 
 		 173 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  45.64 
 
 		 173 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.95 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  46.5 
 
 		 186 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>