More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0856 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
237 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  35.09 
 
 
233 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  36.24 
 
 
234 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  35.53 
 
 
233 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3900  alpha/beta hydrolase fold  35.65 
 
 
235 aa  131  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.479584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  38.33 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1738  alpha/beta hydrolase fold  37.17 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44874  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  34.21 
 
 
233 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  26.11 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
259 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  32.02 
 
 
239 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 
245 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  34.23 
 
 
237 aa  99.8  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  36.48 
 
 
239 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
232 aa  99  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  32.58 
 
 
236 aa  95.5  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
239 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  37.66 
 
 
231 aa  88.6  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 
251 aa  82  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2368  alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.85 
 
 
277 aa  79  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.15 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00281  putative hydrolase  28.24 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.210482  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.38 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.45 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  31.84 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  35.64 
 
 
393 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  30.93 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  32.65 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  32.19 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  33.52 
 
 
393 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  30.98 
 
 
277 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
289 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.57 
 
 
283 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  22.63 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 
350 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
273 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.4 
 
 
264 aa  62.4  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 
288 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  27.69 
 
 
264 aa  62  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  30.99 
 
 
263 aa  62  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0665  thioesterase  32.34 
 
 
475 aa  62  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0117  alpha/beta hydrolase  23.74 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  27.8 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  32.34 
 
 
393 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  29.91 
 
 
264 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
345 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 
277 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  30.59 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.14 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  35.87 
 
 
277 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  29.55 
 
 
277 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  28.33 
 
 
229 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
261 aa  60.1  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  31.3 
 
 
391 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  22.7 
 
 
261 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
263 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  30.67 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 
267 aa  59.7  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  29.44 
 
 
263 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 
263 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
352 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.78 
 
 
269 aa  59.3  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 
265 aa  59.3  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  30.73 
 
 
396 aa  58.9  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0348  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.43 
 
 
205 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
264 aa  58.9  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
275 aa  58.9  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 
281 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 
265 aa  58.5  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
276 aa  58.5  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  22.86 
 
 
264 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  33.07 
 
 
397 aa  58.5  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.94 
 
 
320 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  24.35 
 
 
263 aa  58.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
301 aa  58.5  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  34.83 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  28.65 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>