More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0836 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  100 
 
 
221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  77.93 
 
 
222 aa  360  8e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  77.93 
 
 
222 aa  359  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  77.48 
 
 
222 aa  356  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  77.03 
 
 
222 aa  354  6.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  77.03 
 
 
222 aa  354  6.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  62.61 
 
 
222 aa  305  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  66.96 
 
 
223 aa  297  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  60.63 
 
 
219 aa  295  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  63.72 
 
 
225 aa  289  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  64.44 
 
 
224 aa  289  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  64 
 
 
224 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  64.49 
 
 
224 aa  280  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  62.22 
 
 
224 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  64.95 
 
 
224 aa  279  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  58.33 
 
 
223 aa  241  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.39 
 
 
227 aa  234  7e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  52.34 
 
 
223 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  52.8 
 
 
223 aa  224  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  48.17 
 
 
214 aa  218  7e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  53.21 
 
 
231 aa  210  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  53.46 
 
 
226 aa  208  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  51.58 
 
 
234 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  47.17 
 
 
214 aa  201  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  51.13 
 
 
229 aa  197  9e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  49.09 
 
 
224 aa  197  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  48.08 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  50.23 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  48.08 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  48.08 
 
 
222 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  47.12 
 
 
215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  49.77 
 
 
220 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  39.71 
 
 
220 aa  176  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.13 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.19 
 
 
212 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  42.08 
 
 
239 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  45.73 
 
 
218 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.84 
 
 
218 aa  148  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.53 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  39.06 
 
 
209 aa  132  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  38.14 
 
 
216 aa  133  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  39.49 
 
 
167 aa  105  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  35.97 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  31.05 
 
 
231 aa  78.2  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  29.84 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  33.82 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  37.5 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  37.5 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  29.53 
 
 
218 aa  72  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  32.85 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  33.58 
 
 
217 aa  72  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  31.62 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  29.63 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  32.12 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  31.11 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  25.85 
 
 
828 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.61 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  30.91 
 
 
835 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  30.91 
 
 
843 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  30.91 
 
 
835 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  27.59 
 
 
812 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  32.11 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  30.48 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  23.38 
 
 
792 aa  65.5  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  32.32 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  32.32 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  36.89 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  28.5 
 
 
196 aa  62  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  27.01 
 
 
230 aa  62  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.61 
 
 
221 aa  62  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  25.59 
 
 
833 aa  61.6  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  39.32 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.32 
 
 
786 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  29.47 
 
 
846 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.82 
 
 
231 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  40 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  30 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  25 
 
 
810 aa  58.9  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  29.25 
 
 
808 aa  58.5  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  25.37 
 
 
781 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  28.8 
 
 
196 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  36.26 
 
 
188 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.32 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0056  ATP-dependent protease La  24.15 
 
 
825 aa  57.4  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  36.26 
 
 
788 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  36.26 
 
 
788 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  26.5 
 
 
774 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  33.61 
 
 
241 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  32.71 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.06 
 
 
233 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.8 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  28.92 
 
 
217 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  25.6 
 
 
811 aa  55.5  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.9 
 
 
191 aa  55.5  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  31.46 
 
 
218 aa  55.1  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  27.87 
 
 
196 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  36.84 
 
 
217 aa  55.1  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  24.04 
 
 
810 aa  55.1  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  37.72 
 
 
217 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>