159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0785 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  100 
 
 
417 aa  788    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  59.16 
 
 
439 aa  342  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  58.01 
 
 
438 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  34.31 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  36.52 
 
 
414 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  35.01 
 
 
422 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  37.99 
 
 
442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  38.24 
 
 
442 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  34.16 
 
 
425 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  33.83 
 
 
419 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  36.06 
 
 
450 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  33.42 
 
 
422 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  27.65 
 
 
495 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  28.21 
 
 
495 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  35.49 
 
 
422 aa  150  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  32.34 
 
 
463 aa  147  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  34.26 
 
 
415 aa  146  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  34.18 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  33.25 
 
 
480 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  34.35 
 
 
435 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  35.31 
 
 
474 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  34.27 
 
 
445 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  35.4 
 
 
419 aa  136  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  33.76 
 
 
409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  32.79 
 
 
466 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  34.01 
 
 
422 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  34.01 
 
 
485 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  34.86 
 
 
458 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  32.73 
 
 
476 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  30.07 
 
 
479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  31.62 
 
 
470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  34.99 
 
 
434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  29.88 
 
 
445 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  35.64 
 
 
430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  34.11 
 
 
457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  34.6 
 
 
424 aa  126  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  36.17 
 
 
456 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  34.49 
 
 
504 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  33.95 
 
 
427 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  35.82 
 
 
429 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  33.68 
 
 
423 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  35.54 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  35.78 
 
 
463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  32.92 
 
 
450 aa  121  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  30.52 
 
 
468 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  31.31 
 
 
463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  33.08 
 
 
469 aa  113  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  26.4 
 
 
436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  30.36 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  33.58 
 
 
412 aa  111  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  34.16 
 
 
476 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  30 
 
 
433 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  34.84 
 
 
1199 aa  99.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  32.2 
 
 
418 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  28.54 
 
 
481 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  33.09 
 
 
446 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  32.94 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  28.94 
 
 
470 aa  82.4  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  30.02 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  25.67 
 
 
422 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  30.7 
 
 
451 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  33.09 
 
 
426 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  25.11 
 
 
628 aa  73.6  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  28.01 
 
 
408 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  29.41 
 
 
536 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  33.08 
 
 
411 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  24.89 
 
 
492 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  28.04 
 
 
1274 aa  63.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  24.6 
 
 
657 aa  63.5  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  31.7 
 
 
407 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  27.69 
 
 
999 aa  60.1  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  28.34 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  25.2 
 
 
484 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  33.22 
 
 
456 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  29.27 
 
 
493 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  29.27 
 
 
493 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  29.27 
 
 
493 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  23.09 
 
 
418 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  26.46 
 
 
624 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  27.31 
 
 
445 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  24.31 
 
 
592 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  25.06 
 
 
496 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  26.76 
 
 
498 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  26.76 
 
 
498 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  44.12 
 
 
435 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  25.44 
 
 
528 aa  53.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  43.48 
 
 
492 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  25 
 
 
484 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  27.96 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  26.05 
 
 
625 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  30 
 
 
487 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  50 
 
 
491 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  45.28 
 
 
478 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  45.28 
 
 
478 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  50.91 
 
 
492 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  24.15 
 
 
496 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  45.28 
 
 
482 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  25.88 
 
 
577 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  40.32 
 
 
482 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  26.77 
 
 
490 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>