More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0747 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  100 
 
 		 238 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  89.92 
 
 		 238 aa  431  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  89.92 
 
 		 238 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  89.5 
 
 		 238 aa  430  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  86.97 
 
 		 238 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  86.13 
 
 		 238 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  70.22 
 
 		 274 aa  328  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  65.81 
 
 		 241 aa  321  7e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  66.53 
 
 		 237 aa  320  9.000000000000001e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  66.38 
 
 		 236 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  66.53 
 
 		 237 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.68 
 
 		 237 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  66.1 
 
 		 237 aa  316  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.41 
 
 		 237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  62.66 
 
 		 248 aa  309  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  67.26 
 
 		 236 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.61 
 
 		 227 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  66.81 
 
 		 236 aa  304  7e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  66.37 
 
 		 236 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.83 
 
 		 243 aa  291  8e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  61.78 
 
 		 239 aa  289  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  63.27 
 
 		 239 aa  288  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  62.77 
 
 		 239 aa  288  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  62.77 
 
 		 239 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  59.29 
 
 		 241 aa  268  8e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.15 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  55.35 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.92 
 
 		 308 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.8 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  51.98 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.92 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.38 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  51.38 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.25 
 
 		 228 aa  207  9e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.25 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  46.79 
 
 		 228 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.25 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  46.79 
 
 		 228 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  46.79 
 
 		 228 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.25 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  47.03 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2368  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.88 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27054  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.71 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.58 
 
 		 229 aa  206  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.33 
 
 		 228 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0970  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.77 
 
 		 230 aa  204  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.12 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.96 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  44.75 
 
 		 229 aa  195  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  44.55 
 
 		 232 aa  194  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.66 
 
 		 229 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  45 
 
 		 228 aa  194  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  45 
 
 		 228 aa  194  8.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  44.09 
 
 		 228 aa  194  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  44.24 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  46.32 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  44.5 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  43.64 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.84 
 
 		 229 aa  193  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  47.16 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  43.64 
 
 		 228 aa  191  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  45.91 
 
 		 227 aa  191  7e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.13 
 
 		 231 aa  191  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  43.64 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.29 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  43.78 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1108  Tol-Pal system TolQ  50.23 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00793891  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  43.78 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  44.69 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  43.81 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.81 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  44.69 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  44.69 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  44.69 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  44.7 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  45.21 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  42.99 
 
 		 226 aa  188  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  44.21 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  43.84 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  44.21 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  43.81 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.33 
 
 		 221 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  43.81 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  47.18 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  43.38 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  44.29 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.56 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00697  membrane spanning protein in TolA-TolQ-TolR complex  43.64 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000447277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2898  protein TolQ  43.64 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0790  colicin uptake protein TolQ  43.64 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.9487499999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0766  colicin uptake protein TolQ  43.64 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000589791  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00686  hypothetical protein  43.64 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000828113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0760  colicin uptake protein TolQ  43.64 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000115881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0840  colicin uptake protein TolQ  43.64 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248692  normal  0.940018 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0659  colicin uptake protein TolQ  43.64 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.56356e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.17 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0903  colicin uptake protein TolQ  43.64 
 
 		 230 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000748349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0841  colicin uptake protein TolQ  43.64 
 
 		 230 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000287891  normal  0.682306 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.95 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>