More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0643 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0643  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
224 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  68.44 
 
 
226 aa  271  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  68.89 
 
 
226 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  67.56 
 
 
226 aa  256  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4430  peptidase M22 glycoprotease  66.95 
 
 
232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0939599  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3393  peptidase M22 glycoprotease  58.19 
 
 
231 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  55.11 
 
 
259 aa  198  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  52.89 
 
 
234 aa  185  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  51.98 
 
 
227 aa  184  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  53.18 
 
 
231 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  51.8 
 
 
231 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  50.23 
 
 
232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  50.46 
 
 
232 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  50.68 
 
 
233 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  50.45 
 
 
230 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  50.45 
 
 
231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  39.21 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  39.48 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  37 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  37.28 
 
 
261 aa  118  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  37.28 
 
 
261 aa  118  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  40.18 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150711 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  34.91 
 
 
229 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  42.13 
 
 
213 aa  108  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3613  peptidase M22 glycoprotease  41.44 
 
 
230 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  35.14 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  31.36 
 
 
235 aa  89.7  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3763  peptidase M22, glycoprotease  39.43 
 
 
232 aa  88.6  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  31.76 
 
 
238 aa  87.8  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3029  peptidase M22, glycoprotease  32.72 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  30.99 
 
 
236 aa  82  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  39.55 
 
 
236 aa  82  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1747  glycoprotein endopeptidase  34.67 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.3762  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  29.68 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01100  putative glycoprotease family exported protein  29.76 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  38.1 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0341  peptidase M22, glycoprotease  34.94 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  36.15 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  36.15 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1546  peptidase M22 glycoprotease  30.18 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.311826 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1857  peptidase M22 glycoprotease  33.48 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00567012  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  33.07 
 
 
241 aa  78.2  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0210  endopeptidase-related protein  34.59 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  34.92 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0379  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  28.15 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.457617  hitchhiker  0.000000359774 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  34.75 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  26.92 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  31.25 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  25.37 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  31.25 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0863  peptidase M22, glycoprotease  31.74 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0800  peptidase M22 glycoprotease  31.25 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  32.17 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1759  hypothetical protein  30.26 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.607918  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  31.25 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  31.25 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  31.25 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1268  peptidase M22, glycoprotease  31.01 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  37.21 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  35.71 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  29.59 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  29.59 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  26.24 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  33.78 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  31.06 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  30.47 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1786  peptidase M22, glycoprotease  34.88 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0677325  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  28.99 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  31.49 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  34.92 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0335  peptidase M22, glycoprotease  29.55 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.851961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1258  peptidase M22, glycoprotease  31.6 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000258802  hitchhiker  0.00045804 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  35.46 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  34.92 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  28.99 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  34.92 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  30.15 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  33.08 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  34.92 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  31.06 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  37.5 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0730  glycoprotease family protein  29.32 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  32.12 
 
 
233 aa  72  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3849  peptidase M22 glycoprotease  35.67 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434015  normal  0.803149 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  28.33 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0091  peptidase M22 glycoprotease  41.05 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0427385  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  39.06 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  31.58 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0099  M22 family peptidase  30.12 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192145 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  33.08 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  34.13 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  34.13 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0888  peptidase M22, glycoprotease  38.85 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0332753  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  31.45 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  35.48 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2213  hypothetical protein  38.85 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2256  peptidase M22 glycoprotease  38.76 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0343569  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1525  peptidase M22, glycoprotease  39.84 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.365073  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0731  peptidase M22 glycoprotease  40.58 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0874562  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  35.47 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>