More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0617 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  65.97 
 
 
598 aa  705  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
577 aa  1143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  57.77 
 
 
581 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  57.89 
 
 
583 aa  582  1e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3155  cyclic nucleotide-binding protein  36.94 
 
 
599 aa  309  7e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  35.69 
 
 
584 aa  291  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  31.71 
 
 
621 aa  237  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3179  cyclic nucleotide-binding protein  35.14 
 
 
639 aa  237  5e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.5 
 
 
624 aa  230  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.22 
 
 
597 aa  207  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  30.28 
 
 
583 aa  199  2e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  31.96 
 
 
1048 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30 
 
 
748 aa  183  8e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  33.03 
 
 
1065 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.217439 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02481  Lysophospholipase nte1 (EC 3.1.1.5)(Neuropathy target esterase homolog)(Intracellular phospholipase B) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAE9]  25.4 
 
 
1408 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0963788  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  29.48 
 
 
594 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18298  predicted protein  30.27 
 
 
1275 aa  147  6e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33358  predicted protein  22.9 
 
 
1546 aa  127  7e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.176236 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  32.67 
 
 
323 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  32.96 
 
 
276 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  42.16 
 
 
259 aa  123  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  32.67 
 
 
323 aa  123  1e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  31.09 
 
 
250 aa  121  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  31.34 
 
 
315 aa  119  2e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  30.61 
 
 
727 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  2.93733e-06 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30628  predicted protein  29.18 
 
 
1085 aa  117  7e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  33.96 
 
 
314 aa  117  8e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  34.04 
 
 
327 aa  116  9e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  30 
 
 
273 aa  115  2e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  35.07 
 
 
760 aa  115  2e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  35.07 
 
 
735 aa  115  2e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  7.55516e-06  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  31.91 
 
 
728 aa  115  2e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  31.85 
 
 
320 aa  114  4e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  31.85 
 
 
320 aa  114  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  29.97 
 
 
728 aa  112  1e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  32.84 
 
 
315 aa  112  1e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  31.6 
 
 
300 aa  112  1e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  32.84 
 
 
315 aa  112  2e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04180  hydrolase, putative  29.67 
 
 
1588 aa  112  2e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  35.1 
 
 
734 aa  112  2e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  30.51 
 
 
751 aa  112  2e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  29.33 
 
 
735 aa  111  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  36.31 
 
 
311 aa  111  4e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  30.17 
 
 
728 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  32.53 
 
 
790 aa  110  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  30.85 
 
 
733 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  30.27 
 
 
326 aa  109  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  36.41 
 
 
287 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  33.18 
 
 
751 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  6.72418e-09 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  33.33 
 
 
738 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  37.11 
 
 
728 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  29.81 
 
 
253 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.06968e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  32.86 
 
 
738 aa  107  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  32.86 
 
 
738 aa  107  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  37.11 
 
 
728 aa  106  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  32.38 
 
 
737 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  32.38 
 
 
738 aa  107  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  3.04178e-12 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  37.5 
 
 
335 aa  106  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  32.38 
 
 
738 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  9.66561e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  36.97 
 
 
796 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  36.93 
 
 
256 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  36.49 
 
 
804 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  36.97 
 
 
798 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  3.95852e-07 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  39.55 
 
 
343 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  31.9 
 
 
738 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  36.49 
 
 
803 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  38.07 
 
 
345 aa  104  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  36.49 
 
 
803 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  36.49 
 
 
803 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  2.95709e-05 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  33.82 
 
 
740 aa  104  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  36.41 
 
 
335 aa  104  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  36.41 
 
 
333 aa  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  32.78 
 
 
311 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  37.36 
 
 
262 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  35.05 
 
 
740 aa  103  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  32.86 
 
 
739 aa  103  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  36.15 
 
 
728 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  34.43 
 
 
260 aa  103  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  33.97 
 
 
741 aa  103  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  30.95 
 
 
738 aa  103  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  36.15 
 
 
930 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  37.29 
 
 
320 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  36.15 
 
 
920 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  36.15 
 
 
933 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  36.15 
 
 
945 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  32.38 
 
 
754 aa  103  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  36.15 
 
 
852 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  36.61 
 
 
333 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  31.9 
 
 
736 aa  102  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  33.33 
 
 
263 aa  102  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  3.90545e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  37.09 
 
 
813 aa  102  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  37.71 
 
 
323 aa  101  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  35.16 
 
 
707 aa  101  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  36.61 
 
 
320 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  35.26 
 
 
272 aa  101  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  36.61 
 
 
320 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  35.12 
 
 
348 aa  101  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  34.62 
 
 
301 aa  100  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  29.9 
 
 
753 aa  100  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  30.94 
 
 
319 aa  100  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>