More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0574 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
396 aa  798    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  81.28 
 
 
425 aa  607  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  81.28 
 
 
466 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  81.28 
 
 
424 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  70.28 
 
 
426 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  69.51 
 
 
416 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  39.74 
 
 
421 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  38.99 
 
 
401 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  37.93 
 
 
401 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  37.8 
 
 
404 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  35.2 
 
 
388 aa  219  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  36.08 
 
 
399 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  36.05 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  35.09 
 
 
410 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  35.26 
 
 
407 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  34.31 
 
 
420 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  34.28 
 
 
464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  34.41 
 
 
379 aa  193  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  34.84 
 
 
517 aa  190  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  34.76 
 
 
391 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.39 
 
 
411 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  35.39 
 
 
411 aa  186  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  33.52 
 
 
406 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  30.83 
 
 
447 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  29.77 
 
 
450 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  32.81 
 
 
406 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  35.89 
 
 
427 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  30.31 
 
 
447 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.4 
 
 
465 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  34.99 
 
 
400 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  30.96 
 
 
401 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
348 aa  166  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  31.65 
 
 
424 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  31.13 
 
 
405 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 
494 aa  156  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  32.04 
 
 
405 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  30.21 
 
 
381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  30.53 
 
 
370 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  29.32 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  29.68 
 
 
367 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  42.94 
 
 
439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.26 
 
 
440 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  33.88 
 
 
483 aa  97.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  38.12 
 
 
431 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  30.34 
 
 
911 aa  94  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  34.62 
 
 
614 aa  93.6  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  27.48 
 
 
860 aa  93.2  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  34.69 
 
 
459 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  30.41 
 
 
1133 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  28.5 
 
 
861 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.49 
 
 
465 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  35.03 
 
 
740 aa  91.3  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  32.28 
 
 
284 aa  90.9  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 
586 aa  90.5  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  29.9 
 
 
1130 aa  90.1  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  27.13 
 
 
797 aa  89.7  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  34.64 
 
 
571 aa  89.4  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  32.34 
 
 
971 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.76 
 
 
637 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.67 
 
 
737 aa  89.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  32.93 
 
 
483 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  32.66 
 
 
859 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  33.13 
 
 
1805 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  32.93 
 
 
483 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  32.97 
 
 
638 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0730  hypothetical protein  34.69 
 
 
437 aa  87.4  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  30.05 
 
 
607 aa  87.4  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0710  hypothetical protein  34.69 
 
 
437 aa  87.4  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  31.71 
 
 
864 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  31.29 
 
 
701 aa  87  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  32.28 
 
 
1119 aa  86.7  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.39 
 
 
696 aa  86.7  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  31.73 
 
 
645 aa  86.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  28.18 
 
 
936 aa  85.9  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  27 
 
 
479 aa  86.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  35.48 
 
 
858 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  32.76 
 
 
643 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  33.56 
 
 
532 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.91 
 
 
500 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.11 
 
 
650 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  31.64 
 
 
729 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.75 
 
 
658 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  31.72 
 
 
358 aa  84  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  34.87 
 
 
593 aa  83.2  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  33.89 
 
 
903 aa  82.8  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5211  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.3 
 
 
529 aa  82.8  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  29.93 
 
 
701 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  31.12 
 
 
441 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  34.97 
 
 
667 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  37.23 
 
 
364 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.89 
 
 
757 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  31.3 
 
 
969 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.35 
 
 
611 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
712 aa  80.9  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
741 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.96 
 
 
652 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  30.61 
 
 
431 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  37.58 
 
 
464 aa  80.5  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  34.64 
 
 
564 aa  80.5  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  29.09 
 
 
632 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>