78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0548 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0548  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303281  normal  0.0576469 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2059  protein of unknown function DUF952  80.17 
 
 
116 aa  183  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2383  protein of unknown function DUF952  77.88 
 
 
116 aa  179  9.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4536  protein of unknown function DUF952  77.88 
 
 
115 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2107  hypothetical protein  76.11 
 
 
116 aa  176  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.808396  normal  0.0238058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3257  hypothetical protein  72.57 
 
 
115 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0093  hypothetical protein  66.97 
 
 
115 aa  153  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0405  hypothetical protein  66.67 
 
 
116 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0326  hypothetical protein  67.59 
 
 
117 aa  148  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1468  hypothetical protein  66.67 
 
 
120 aa  147  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0312  hypothetical protein  67.59 
 
 
117 aa  147  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0585  hypothetical protein  65.42 
 
 
143 aa  140  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0162  hypothetical protein  66.36 
 
 
115 aa  139  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal  0.834789 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3797  protein of unknown function DUF952  63.3 
 
 
128 aa  137  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.899474 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0436  hypothetical protein  61.47 
 
 
118 aa  134  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0756  hypothetical protein  60 
 
 
114 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824326  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0221  protein of unknown function DUF952  58.72 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0864  protein of unknown function DUF952  59.09 
 
 
114 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0792  hypothetical protein  60 
 
 
114 aa  129  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4623  hypothetical protein  59.81 
 
 
114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0192  protein of unknown function DUF952  57.8 
 
 
117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1067  hypothetical protein  55.96 
 
 
117 aa  128  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0787  hypothetical protein  57.27 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.732307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0465  hypothetical protein  57.27 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0556  hypothetical protein  56.07 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3013  hypothetical protein  55.86 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0848  protein of unknown function DUF952  59.26 
 
 
111 aa  114  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0194191  normal  0.118784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1917  hypothetical protein  50.93 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0606069  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0956  hypothetical protein  54.05 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2616  hypothetical protein  54.05 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0387  hypothetical protein  53.33 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.580664  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2897  hypothetical protein  50.93 
 
 
115 aa  104  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.359855 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1549  hypothetical protein  55.36 
 
 
112 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0531492  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1163  hypothetical protein  48.94 
 
 
103 aa  101  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0556708  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2962  hypothetical protein  55.45 
 
 
111 aa  98.6  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0513  hypothetical protein  45.19 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11264  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2883  hypothetical protein  50.49 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646253  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0517  hypothetical protein  41.28 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5199  protein of unknown function DUF952  42.42 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157492  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2456  hypothetical protein  40.37 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4589  protein of unknown function DUF952  41.82 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  hitchhiker  0.00537497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0861  hypothetical protein  42.59 
 
 
114 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00940  hypothetical protein  40.74 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2860  hypothetical protein  30.61 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000466115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2970  hypothetical protein  37.61 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3672  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2171  hypothetical protein  38.74 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0419076  hitchhiker  0.00150651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2228  hypothetical protein  38.74 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2182  hypothetical protein  38.74 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0952783  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3943  hypothetical protein  38.18 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2172  hypothetical protein  37.39 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12720  hypothetical protein  36.45 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  36 
 
 
323 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1916  hypothetical protein  30.43 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.21 
 
 
323 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3868  hypothetical protein  41.76 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2571  hypothetical protein  29 
 
 
112 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000205599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2472  hypothetical protein  27.78 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0467967  normal  0.531693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2622  hypothetical protein  28 
 
 
112 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0382701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2614  hypothetical protein  28.83 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0019859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2838  hypothetical protein  27.66 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000244787  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3986  protein of unknown function DUF952  39 
 
 
374 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2813  hypothetical protein  27.55 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0272117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2820  hypothetical protein  27.55 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000165343 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2538  hypothetical protein  28 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.070285  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1066  protein of unknown function DUF952  27.59 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.210696 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  40.58 
 
 
333 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2563  protein of unknown function DUF952  26.67 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0080  protein of unknown function DUF952  34.91 
 
 
108 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1680  protein of unknown function DUF952  40 
 
 
103 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3543  protein of unknown function DUF952  25.71 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4927  protein of unknown function DUF952  34.95 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4550  hypothetical protein  35.92 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1988  hypothetical protein  24.77 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.727763  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12470  hypothetical protein  31.37 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144496  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1633  protein of unknown function DUF952  32 
 
 
120 aa  45.1  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0372909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4808  protein of unknown function DUF985  32.95 
 
 
286 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_09462  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>