More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0504 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0745  aspartyl-tRNA synthetase  60.46 
 
 
595 aa  763    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1592  aspartyl-tRNA synthetase  59.52 
 
 
601 aa  750    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1519  aspartyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
605 aa  640    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000463103  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2557  aspartyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
609 aa  712    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0413  aspartyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 
600 aa  670    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1016  aspartyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 
608 aa  641    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90482  normal  0.914473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0450  aspartyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 
599 aa  741    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0751  aspartyl-tRNA synthetase  60.46 
 
 
595 aa  763    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3864  aspartyl-tRNA synthetase  65.25 
 
 
590 aa  819    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1396  aspartyl-tRNA synthetase  71.29 
 
 
597 aa  917    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3302  aspartyl-tRNA synthetase  63.7 
 
 
607 aa  790    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465914  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2541  aspartyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 
595 aa  752    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210193  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3140  aspartyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 
623 aa  803    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.545815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1104  aspartyl-tRNA synthetase  60 
 
 
596 aa  749    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507446  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0672  aspartyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 
590 aa  668    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.301206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1588  aspartyl-tRNA synthetase  66.23 
 
 
590 aa  828    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.858986  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1469  aspartyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 
608 aa  657    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000021993  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0815  aspartyl-tRNA synthetase  60.26 
 
 
591 aa  728    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1320  aspartyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 
604 aa  637    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0251551  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0868  aspartyl-tRNA synthetase  57.8 
 
 
596 aa  729    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.925972  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0932  aspartyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 
605 aa  654    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000107292  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0043  aspartyl-tRNA synthetase  63.05 
 
 
593 aa  767    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000554718  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2465  aspartyl-tRNA synthetase  84.53 
 
 
604 aa  1057    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858075  normal  0.022913 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2072  aspartyl-tRNA synthetase  62.64 
 
 
606 aa  749    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0802  aspartyl-tRNA synthetase  60.81 
 
 
595 aa  752    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.336028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2496  aspartyl-tRNA synthetase  65.85 
 
 
590 aa  827    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525645  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1338  aspartyl-tRNA synthetase  61.74 
 
 
593 aa  760    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.427897  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0334  aspartyl-tRNA synthetase  54.44 
 
 
590 aa  679    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3166  aspartyl-tRNA synthetase  57.61 
 
 
591 aa  715    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178298  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0209  aspartyl-tRNA synthetase  73.24 
 
 
623 aa  933    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.789469 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1620  aspartyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 
601 aa  646    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0865646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2336  aspartyl-tRNA synthetase  65.58 
 
 
590 aa  828    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.544435  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2947  aspartyl-tRNA synthetase  65.91 
 
 
590 aa  830    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3453  aspartyl-tRNA synthetase  66.45 
 
 
591 aa  838    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0866598  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2111  aspartyl-tRNA synthetase  66.18 
 
 
590 aa  830    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2633  aspartyl-tRNA synthetase  58.48 
 
 
590 aa  726    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530132  normal  0.0940983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0635  aspartyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 
594 aa  710    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.312658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1751  aspartyl-tRNA synthetase  64.2 
 
 
619 aa  767    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96886  normal  0.294173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1122  aspartyl-tRNA synthetase  60.1 
 
 
594 aa  753    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2472  aspartyl-tRNA synthetase  60.26 
 
 
591 aa  728    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0952045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2168  aspartyl-tRNA synthetase  86.32 
 
 
604 aa  1076    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271234  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1258  aspartyl-tRNA synthetase  58.96 
 
 
605 aa  746    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000886805 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2364  aspartyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 
595 aa  753    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0504  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
625 aa  1283    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0413061  normal  0.734988 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0365  aspartyl-tRNA synthetase  59.34 
 
 
591 aa  724    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4374  aspartyl-tRNA synthetase  89.09 
 
 
604 aa  1112    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4486  aspartyl-tRNA synthetase  89.41 
 
 
604 aa  1105    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350526  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1650  aspartyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 
606 aa  636    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2183  aspartyl-tRNA synthetase  59.44 
 
 
591 aa  718    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.403701  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4005  aspartyl-tRNA synthetase  88.48 
 
 
614 aa  1121    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1251  aspartyl-tRNA synthetase  60 
 
 
596 aa  748    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0477  aspartyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 
588 aa  610  1e-173  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000218693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1543  aspartyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 
581 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00178145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 
600 aa  558  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
603 aa  552  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
588 aa  537  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
598 aa  529  1e-149  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
598 aa  526  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
598 aa  523  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
597 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
589 aa  514  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
594 aa  514  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
592 aa  509  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
586 aa  508  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
597 aa  502  1e-141  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
613 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
592 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
591 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
599 aa  499  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
594 aa  500  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
593 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
604 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
591 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 
600 aa  498  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
589 aa  498  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
595 aa  497  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
599 aa  498  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
599 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
596 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
592 aa  491  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
594 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
589 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 
595 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
607 aa  491  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
602 aa  492  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
591 aa  487  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
598 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
619 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
591 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
626 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
617 aa  488  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
591 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
592 aa  488  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 
597 aa  486  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
591 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
591 aa  483  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
591 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
591 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
599 aa  482  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
591 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>