30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0448 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  898    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  73.48 
 
 
445 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  72.51 
 
 
458 aa  585  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  72.99 
 
 
458 aa  585  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  70.94 
 
 
450 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  71.03 
 
 
442 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  49.04 
 
 
448 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  45.31 
 
 
449 aa  330  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  39.55 
 
 
435 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  41.98 
 
 
427 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  41.75 
 
 
427 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  41.37 
 
 
427 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4783  putative MFS superfamily transport protein  41.28 
 
 
453 aa  286  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127813  normal  0.486857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  42.37 
 
 
438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4002  major facilitator transporter  42.43 
 
 
463 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  39.72 
 
 
429 aa  281  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  41.86 
 
 
430 aa  277  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  40.67 
 
 
439 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  41.62 
 
 
436 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1331  major facilitator superfamily MFS_1  40.58 
 
 
439 aa  247  4e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865021  normal  0.03557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  35.55 
 
 
441 aa  231  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01661  hypothetical protein  35.54 
 
 
385 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450943  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  27.32 
 
 
939 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1256  ATP/ADP translocase-like  24.1 
 
 
450 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1488  ATP/ADP translocase-like protein  25.09 
 
 
803 aa  56.6  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  21.52 
 
 
529 aa  55.5  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3729  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.57 
 
 
909 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369293  normal  0.981995 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1797  major facilitator transporter  41.07 
 
 
73 aa  52.8  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000398276  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50189  nucleotide transporter 3  22.37 
 
 
666 aa  50.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49533  nucleotide transporter 1  24.02 
 
 
610 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>