80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0432 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0432  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  295  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2623  response regulator receiver protein  82.64 
 
 		 150 aa  233  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6170  hypothetical protein  60.48 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1555  hypothetical protein  63.48 
 
 		 168 aa  140  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0074  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.46 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.46 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5600  response regulator receiver protein  41.9 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  35.71 
 
 		 376 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  36.08 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7958  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  32.76 
 
 		 852 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  34.02 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  34.02 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5585  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  35.06 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4110  response regulator receiver protein  35.64 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00730632  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  29.69 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 602 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0717  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0892969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  30 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  37.66 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0251  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3234  response regulator receiver protein  27.15 
 
 		 207 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0140449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  30 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  33.77 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 1111 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.27 
 
 		 384 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  29.23 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 559 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  28.32 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1154  response regulator receiver protein  33.98 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  31.48 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  37.5 
 
 		 1096 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00619  two-component system regulatory protein  35.42 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1001  response regulator receiver protein  33.98 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283402  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  28.83 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  36 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  29.41 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  36.45 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  25.69 
 
 		 846 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 631 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  27.1 
 
 		 847 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  26.17 
 
 		 847 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  25.69 
 
 		 847 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0677  putative two component-response regulator receiver (CheY-like protein)  33.33 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339833 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  28.57 
 
 		 844 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  32.63 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 127 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  27.68 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  34.62 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0440  response regulator receiver protein  28.43 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0544928  normal  0.588008 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1096 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0407  response regulator receiver  28.43 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2651  response regulator  28.33 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00566392  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5902  response regulator receiver and SARP domain protein  28.57 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2399  response regulator receiver protein  27.55 
 
 		 128 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0186457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3180  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0167969  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0073  response regulator receiver protein  30 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  28.43 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 		 404 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0604  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 147 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>