175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0342 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0342  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 
303 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106695  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4622  phosphatidylserine decarboxylase  68.04 
 
 
292 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4806  phosphatidylserine decarboxylase  66.9 
 
 
291 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6208  putative phosphatidylserine decarboxylase  56.49 
 
 
293 aa  326  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000986716  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0699  phosphatidylserine decarboxylase  57.54 
 
 
297 aa  325  6e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671844  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3604  phosphatidylserine decarboxylase  57.99 
 
 
290 aa  322  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247299 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  31.96 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0913  phosphatidylserine decarboxylase  32.42 
 
 
302 aa  133  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113131  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  33.33 
 
 
288 aa  133  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  36.9 
 
 
289 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  33.09 
 
 
288 aa  130  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  30.07 
 
 
286 aa  129  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0634  phosphatidylserine decarboxylase  33.57 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697003  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  36.26 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4116  phosphatidylserine decarboxylase  34.04 
 
 
284 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0718  phosphatidylserine decarboxylase  33.92 
 
 
293 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  33.94 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  31.25 
 
 
293 aa  126  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  31.25 
 
 
293 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  33.08 
 
 
286 aa  126  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  31.25 
 
 
293 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0422  phosphatidylserine decarboxylase  29.9 
 
 
316 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161477  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  33.7 
 
 
303 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1300  phosphatidylserine decarboxylase  32.6 
 
 
294 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  33.59 
 
 
285 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2859  phosphatidylserine decarboxylase  33.92 
 
 
280 aa  123  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1716  phosphatidylserine decarboxylase  35.6 
 
 
283 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0895386  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  32.27 
 
 
285 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01257  phosphatidylserine decarboxylase  34.8 
 
 
273 aa  122  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  30.82 
 
 
322 aa  122  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04030  phosphatidylserine decarboxylase  30.82 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0258247  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  31.18 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  31.18 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  30.82 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4631  phosphatidylserine decarboxylase  30.82 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2446  phosphatidylserine decarboxylase  36.16 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779952  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  35.32 
 
 
284 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  34.11 
 
 
286 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  30.82 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4692  phosphatidylserine decarboxylase  30.82 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  30.82 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  31.18 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  31.18 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  30.82 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  31.25 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  31.18 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  32.69 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  31.6 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  33.94 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  31.25 
 
 
282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  30.47 
 
 
322 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265826  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  30.71 
 
 
300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2358  phosphatidylserine decarboxylase  35.9 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0346  phosphatidylserine decarboxylase  30.82 
 
 
345 aa  119  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  unclonable  0.00000248623 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  34.14 
 
 
284 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  29.66 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  29.66 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  29.51 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  29.66 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  29.66 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  32.97 
 
 
289 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  33.7 
 
 
610 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1509  phosphatidylserine decarboxylase  36.18 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.121972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4088  phosphatidylserine decarboxylase  32.96 
 
 
289 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2796  phosphatidylserine decarboxylase  35.05 
 
 
283 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  29.55 
 
 
289 aa  116  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  33.22 
 
 
286 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  29.51 
 
 
287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  32.97 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0474  phosphatidylserine decarboxylase  30.41 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  33.33 
 
 
613 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  34.33 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  32.97 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  30.2 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4251  phosphatidylserine decarboxylase  38.99 
 
 
285 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  30.53 
 
 
292 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  29.51 
 
 
286 aa  113  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  30.53 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  30.53 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3755  phosphatidylserine decarboxylase  29.7 
 
 
342 aa  113  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  32.36 
 
 
294 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  28.52 
 
 
283 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  32.96 
 
 
287 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2122  phosphatidylserine decarboxylase  35.12 
 
 
280 aa  112  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138271  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4660  phosphatidylserine decarboxylase  33.86 
 
 
284 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0641109  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  27.34 
 
 
287 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  28.52 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  29.26 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  28.12 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0587  phosphatidylserine decarboxylase  30.04 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.31062  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0749  phosphatidylserine decarboxylase  31.52 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3933  phosphatidylserine decarboxylase  29.9 
 
 
318 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  29.85 
 
 
303 aa  110  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0385  phosphatidylserine decarboxylase  29.79 
 
 
304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1650  phosphatidylserine decarboxylase  34.85 
 
 
286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  30.1 
 
 
289 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4381  phosphatidylserine decarboxylase  31.23 
 
 
297 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706772  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3747  phosphatidylserine decarboxylase  32.3 
 
 
296 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2876  phosphatidylserine decarboxylase  37 
 
 
282 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  31.29 
 
 
306 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>