More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0299 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  83.84 
 
 
404 aa  687    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
403 aa  814    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  86.72 
 
 
402 aa  687    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  70.42 
 
 
406 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  67.83 
 
 
405 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3706  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  67.83 
 
 
405 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209947  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  67.79 
 
 
412 aa  526  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  67.36 
 
 
399 aa  523  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  66.25 
 
 
400 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  64.36 
 
 
394 aa  476  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1549  extracellular ligand-binding receptor  60.32 
 
 
392 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000137786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3194  Extracellular ligand-binding receptor  51.62 
 
 
415 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2712  extracellular ligand-binding receptor  49.49 
 
 
405 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620726  hitchhiker  0.00485368 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1770  Extracellular ligand-binding receptor  49.74 
 
 
410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.718343  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1699  Extracellular ligand-binding receptor  49.47 
 
 
410 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.574188  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2179  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  49.21 
 
 
410 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1682  extracellular ligand-binding receptor  45.78 
 
 
410 aa  340  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000183641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0480  Extracellular ligand-binding receptor  44.44 
 
 
407 aa  341  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  44.79 
 
 
400 aa  324  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0096  extracellular ligand-binding receptor  41.93 
 
 
416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.809601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0150  extracellular ligand-binding receptor  42.13 
 
 
417 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  40.74 
 
 
396 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  40.48 
 
 
396 aa  285  8e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  40.38 
 
 
412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0291  extracellular ligand-binding receptor  38.75 
 
 
401 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  34.97 
 
 
395 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  34.93 
 
 
396 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  35.86 
 
 
393 aa  193  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  35.12 
 
 
396 aa  193  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  34.85 
 
 
396 aa  192  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  34.15 
 
 
394 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  31.76 
 
 
390 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  30.93 
 
 
381 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  30.49 
 
 
379 aa  156  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  29.09 
 
 
392 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  31.51 
 
 
380 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4060  extracellular ligand-binding receptor  32.98 
 
 
400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
379 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 
385 aa  150  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  31.98 
 
 
379 aa  149  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.54 
 
 
380 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  28.5 
 
 
379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  30.4 
 
 
396 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 
394 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 
393 aa  146  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  31.91 
 
 
374 aa  145  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  28.17 
 
 
383 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.85 
 
 
378 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  27.87 
 
 
394 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  27.94 
 
 
379 aa  143  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 
380 aa  142  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  31.32 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  31.32 
 
 
397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  29.7 
 
 
379 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  32.46 
 
 
396 aa  136  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 
389 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  29.83 
 
 
381 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2553  extracellular ligand-binding receptor  31.52 
 
 
386 aa  132  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  29.3 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.23 
 
 
396 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
383 aa  130  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  32.49 
 
 
399 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  31.75 
 
 
372 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  31.75 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  31.75 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.75 
 
 
376 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.75 
 
 
380 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.75 
 
 
380 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.75 
 
 
380 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  30.75 
 
 
380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.75 
 
 
380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 
384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.18 
 
 
376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  31.09 
 
 
382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.75 
 
 
380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  30.71 
 
 
376 aa  127  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.45 
 
 
380 aa  127  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  31.04 
 
 
380 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  30.71 
 
 
381 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  31.36 
 
 
376 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  31.04 
 
 
380 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.75 
 
 
384 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  31.16 
 
 
384 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  31.04 
 
 
380 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  31.15 
 
 
379 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  31.49 
 
 
371 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  29.04 
 
 
381 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  31.75 
 
 
384 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  31.75 
 
 
384 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  31.61 
 
 
393 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 
405 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  30.45 
 
 
380 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  30.34 
 
 
381 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  30.45 
 
 
391 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  30.45 
 
 
391 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.34 
 
 
402 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.45 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1848  extracellular ligand-binding receptor  29.91 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0671771  normal  0.122571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>