58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0170 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0170  malonate decarboxylase, gamma subunit  100 
 
 		 238 aa  461  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.212333  normal  0.869946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0049  malonate decarboxylase, gamma subunit  75.21 
 
 		 238 aa  346  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.0466048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3154  malonate decarboxylase, gamma subunit  73.11 
 
 		 238 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6854  malonate decarboxylase, gamma subunit  73.53 
 
 		 238 aa  339  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0027  malonate decarboxylase, gamma subunit  71.85 
 
 		 238 aa  332  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0028  malonate decarboxylase, gamma subunit  72.27 
 
 		 238 aa  332  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.31944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2047  malonate decarboxylase, gamma subunit  59.75 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3189  malonate decarboxylase, gamma subunit  59.4 
 
 		 245 aa  249  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0791  malonate decarboxylase gamma subunit  58.9 
 
 		 235 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1272  malonate decarboxylase gamma subunit  58.9 
 
 		 235 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00955431  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1244  malonate decarboxylase, gamma subunit  58.47 
 
 		 235 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58858  normal  0.076268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4415  malonate decarboxylase gamma subunit  57.2 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2800  malonate decarboxylase, gamma subunit  60.83 
 
 		 241 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176554  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1162  malonate decarboxylase, gamma subunit  54.92 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166916 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1150  malonate decarboxylase gamma subunit  54.92 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3034  malonate decarboxylase, gamma subunit  59.17 
 
 		 241 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0542  malonate decarboxylase, gamma subunit  59.17 
 
 		 241 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.960263  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1455  malonate decarboxylase, gamma subunit  59.17 
 
 		 241 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0490368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0611  malonate decarboxylase, gamma subunit  59.17 
 
 		 241 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1259  malonate decarboxylase, gamma subunit  59.17 
 
 		 241 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.341202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1485  malonate decarboxylase, gamma subunit  58.75 
 
 		 241 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359721  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1585  malonate decarboxylase, gamma subunit  58.75 
 
 		 241 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.911971  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4289  malonate decarboxylase gamma subunit  58.19 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1078  malonate decarboxylase, gamma subunit  44.35 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5371  malonate decarboxylase, gamma subunit  40 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278339  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1765  malonate decarboxylase, gamma subunit  38.7 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1846  malonate decarboxylase gamma subunit  41.15 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0791  malonate decarboxylase gamma subunit  40.54 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0107616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2892  malonate decarboxylase gamma subunit  36.17 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473236  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2495  hypothetical protein  31.76 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1143  putative malonate decarboxylase gamma subunit  33.19 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.216529  normal  0.546838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0076  malonate decarboxylase, gamma subunit  38.3 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4017  malonate decarboxylase gamma subunit  36.13 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2893  malonate decarboxylase gamma subunit  39.2 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187079  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1325  hypothetical protein  27.49 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3775  malonate decarboxylase gamma subunit  33.89 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3295  malonate decarboxylase gamma subunit  30.05 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2442  malonate decarboxylase, gamma subunit  35.82 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.556713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5298  malonate decarboxylase gamma subunit  33.89 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.47948  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0446  malonate decarboxylase gamma subunit  33.15 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4817  malonate decarboxylase, gamma subunit  29.66 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0587607  normal  0.0256459 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1243  malonate decarboxylase, gamma subunit  34.5 
 
 		 267 aa  67  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2608  malonate decarboxylase, gamma subunit  35.56 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0803004  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5083  malonate decarboxylase, gamma subunit  31.49 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0296  malonate decarboxylase subunit gamma  33.8 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526825  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4589  malonate decarboxylase gamma subunit  33.56 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02590  malonate decarboxylase gamma subunit  34.04 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0619996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1060  malonate decarboxylase gamma subunit  29.24 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0857455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0950  malonate decarboxylase gamma subunit  31.87 
 
 		 268 aa  62  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1848  putative malonate decarboxylase gamma subunit  35.11 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415688  normal  0.0801286 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  28.4 
 
 		 499 aa  58.9  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4929  malonate decarboxylase gamma subunit  34.23 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.616549  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10320  Malonate decarboxylase gamma subunit  32.26 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.056312  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2879  malonate decarboxylase, gamma subunit  29.65 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.994306 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5083  malonate decarboxylase, gamma subunit  29.7 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal  0.178528 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4943  malonate decarboxylase, gamma subunit  32.1 
 
 		 276 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0583911 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3867  malonate decarboxylase, gamma subunit  32.1 
 
 		 276 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3656  malonate decarboxylase gamma subunit  31.82 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>