19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0166 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0166    100 
 
 		 267 bp  529  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325308  normal  0.0268854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6859  malonate transporter, MadM subunit  95.18 
 
 		 765 bp  133  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0044  malonate transporter, MadM subunit  87.61 
 
 		 765 bp  113  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0292354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3149  malonate transporter, MadM subunit  90.91 
 
 		 765 bp  97.6  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0023    90.79 
 
 		 372 bp  95.6  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0024    84.11 
 
 		 291 bp  77.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0300  malonate transporter subunit MadM  85.71 
 
 		 765 bp  65.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.62285  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6324  malonate transporter, MadM subunit  85.71 
 
 		 768 bp  65.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1330  malonate/sodium symporter MadM subunit  87.3 
 
 		 774 bp  61.9  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0787  malonate transporter, MadM subunit  81.9 
 
 		 768 bp  58  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1268  malonate transporter, MadM subunit  81.9 
 
 		 768 bp  58  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4284  malonate/sodium symporter MadM subunit  88.68 
 
 		 765 bp  58  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0339134  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1240  malonate transporter, MadM subunit  81.9 
 
 		 768 bp  58  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761133  normal  0.122304 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3869  malonate transporter, MadM subunit  85.29 
 
 		 765 bp  56  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4945  malonate transporter, MadM subunit  85.29 
 
 		 765 bp  56  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0533752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3290  malonate transporter, MadM subunit  89.36 
 
 		 765 bp  54  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.864394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10360  malonate transporter, MadM subunit  92.31 
 
 		 768 bp  54  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2051  malonate transporter, MadM subunit  82.93 
 
 		 768 bp  52  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2804  malonate transporter, M subunit  83.58 
 
 		 768 bp  46.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>