More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0164 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0164  NmrA family protein  100 
 
 
294 aa  566  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0344706  decreased coverage  0.00561101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  66.9 
 
 
297 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  62.09 
 
 
285 aa  345  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  61.73 
 
 
285 aa  344  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  67.25 
 
 
297 aa  343  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  61.73 
 
 
285 aa  342  2.9999999999999997e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  64.73 
 
 
294 aa  335  7e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  59.71 
 
 
283 aa  335  7.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  59.93 
 
 
283 aa  334  9e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  62.06 
 
 
285 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  59.79 
 
 
285 aa  318  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  61.01 
 
 
285 aa  318  9e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  62.06 
 
 
285 aa  315  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  61.62 
 
 
289 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  65.81 
 
 
284 aa  308  6.999999999999999e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  62.99 
 
 
288 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0209  hypothetical protein  59.04 
 
 
293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0185  NmrA family protein  58.7 
 
 
293 aa  301  6.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2618  NmrA-like protein  62.24 
 
 
294 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439902  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  56.38 
 
 
281 aa  300  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1439  NmrA family protein  64.06 
 
 
284 aa  298  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  56.34 
 
 
285 aa  295  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  52.71 
 
 
286 aa  280  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  52.71 
 
 
286 aa  280  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  53.07 
 
 
282 aa  280  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  53.07 
 
 
286 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  52.71 
 
 
286 aa  280  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  53.07 
 
 
286 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  52.71 
 
 
286 aa  280  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  52.35 
 
 
286 aa  278  7e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  51.99 
 
 
286 aa  276  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  57.72 
 
 
290 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  52.35 
 
 
286 aa  276  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  54.51 
 
 
281 aa  275  9e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03749  oxidoreductase  57.97 
 
 
286 aa  273  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  54.24 
 
 
282 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  53.87 
 
 
282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  53.51 
 
 
282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  53.51 
 
 
282 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  53.51 
 
 
282 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  56.83 
 
 
290 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6230  NmrA family protein  55.12 
 
 
284 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365966  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  55.43 
 
 
303 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  54.84 
 
 
284 aa  265  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0617  NmrA family protein  62.41 
 
 
298 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6399  NmrA-like  54.06 
 
 
284 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6632  NmrA family protein  54.06 
 
 
284 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  54.8 
 
 
280 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  50.52 
 
 
288 aa  255  5e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  48.06 
 
 
282 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  54.32 
 
 
285 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  50.73 
 
 
289 aa  245  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  49.47 
 
 
284 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  48.4 
 
 
285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  52.92 
 
 
279 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  48.42 
 
 
303 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  46.13 
 
 
283 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  50.36 
 
 
285 aa  203  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  45.77 
 
 
285 aa  202  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  45.36 
 
 
271 aa  201  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4158  NmrA family protein  52 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  44.44 
 
 
284 aa  195  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  47.46 
 
 
290 aa  195  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6538  NmrA family protein  41.92 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  41.58 
 
 
278 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  42.76 
 
 
287 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  43.97 
 
 
284 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  40.43 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  40.44 
 
 
291 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  45.88 
 
 
282 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  32.85 
 
 
289 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  38.46 
 
 
283 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  36.43 
 
 
295 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  35.51 
 
 
291 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  38.91 
 
 
287 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  37.41 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  34.75 
 
 
301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  32.2 
 
 
294 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1616  hypothetical protein  38.46 
 
 
289 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.057231  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5395  NmrA family protein  38.73 
 
 
278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  34.77 
 
 
288 aa  138  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  35.77 
 
 
287 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  30.56 
 
 
288 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2475  hypothetical protein  34.31 
 
 
281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0316399  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  36.79 
 
 
285 aa  136  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.4 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2748  NmrA family protein  40.5 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6179  NmrA family protein  33.69 
 
 
294 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0550335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2435  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.36 
 
 
282 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2511  NmrA family protein  33.7 
 
 
302 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0277  NmrA-like  36.17 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022363  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  33.33 
 
 
305 aa  116  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01841  NmrA-like family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02840)  29.08 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.972262 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  25.71 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3899  NmrA family protein  37.41 
 
 
287 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  33.73 
 
 
299 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  34.93 
 
 
294 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1180  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.79 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  27.21 
 
 
292 aa  96.3  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  34.19 
 
 
281 aa  96.3  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>