More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0138 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 
299 aa  567  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  61.25 
 
 
296 aa  298  8e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  61.25 
 
 
296 aa  296  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0893  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  62.46 
 
 
296 aa  293  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615942  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  58.66 
 
 
299 aa  285  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  62.12 
 
 
295 aa  275  7e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  57.51 
 
 
298 aa  251  8.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  53.29 
 
 
291 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  52.67 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  55.07 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  52.55 
 
 
295 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.07 
 
 
286 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  53.21 
 
 
292 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  47.96 
 
 
286 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.56 
 
 
283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  45.19 
 
 
283 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  53.14 
 
 
286 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.33 
 
 
285 aa  209  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  47.47 
 
 
287 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  56.27 
 
 
289 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  48.53 
 
 
292 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  44.84 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  48.48 
 
 
325 aa  200  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.01 
 
 
306 aa  199  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  46.55 
 
 
288 aa  195  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  46.12 
 
 
276 aa  193  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  48 
 
 
283 aa  193  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  46.13 
 
 
319 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.03 
 
 
293 aa  188  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  46.59 
 
 
274 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  44.7 
 
 
297 aa  186  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  47.21 
 
 
278 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  47.84 
 
 
275 aa  185  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.1 
 
 
296 aa  185  8e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  35.21 
 
 
288 aa  183  3e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  43.37 
 
 
274 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  40.94 
 
 
289 aa  178  9e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  42.42 
 
 
278 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  39.21 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  40.5 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  44.88 
 
 
287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.04 
 
 
285 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  39.38 
 
 
285 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  38.85 
 
 
277 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  36.08 
 
 
302 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  41.43 
 
 
293 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  39.64 
 
 
288 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  46.95 
 
 
280 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  46.95 
 
 
280 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  40.88 
 
 
284 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0287  HemK family modification methylase  42.86 
 
 
291 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  36.07 
 
 
285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.07 
 
 
279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  45.24 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  44.81 
 
 
274 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  40.15 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  38.54 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.32 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  38.21 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  44.36 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  39.38 
 
 
283 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  38.55 
 
 
279 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  42.81 
 
 
283 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  45.28 
 
 
280 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  45.49 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1063  HemK family modification methylase  32.7 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  41.96 
 
 
288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  47.47 
 
 
285 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.32 
 
 
276 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  42.86 
 
 
310 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  39.07 
 
 
285 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  46.32 
 
 
276 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.91 
 
 
280 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  38.38 
 
 
301 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  46.43 
 
 
276 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  38.55 
 
 
279 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  45.34 
 
 
284 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  42.75 
 
 
280 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  41.97 
 
 
286 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  45.89 
 
 
276 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0010  HemK family modification methylase  32.84 
 
 
279 aa  159  4e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.175416  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  39.62 
 
 
282 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  49.07 
 
 
295 aa  159  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3604  protein methyltransferase HemK  47.66 
 
 
285 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.3 
 
 
281 aa  158  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  37.01 
 
 
279 aa  158  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.19 
 
 
286 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0677  methyltransferase, HemK family protein  47.66 
 
 
285 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0503  hemK protein  47.66 
 
 
285 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  43.85 
 
 
289 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  47.66 
 
 
285 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  46.4 
 
 
278 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  47.66 
 
 
285 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  37.09 
 
 
280 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  47.66 
 
 
285 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3615  protein hemK  47.66 
 
 
285 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  38.43 
 
 
285 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  43.25 
 
 
289 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0855  modification methylase HemK  32.32 
 
 
280 aa  157  2e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  37.63 
 
 
296 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>