288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0100 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0100  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 		 164 aa  317  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4221  rRNA large subunit methyltransferase  65.22 
 
 		 162 aa  200  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2564  rRNA large subunit methyltransferase  63.58 
 
 		 165 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00528144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2289  rRNA large subunit methyltransferase  63.58 
 
 		 165 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.080755 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4731  rRNA large subunit methyltransferase  64.6 
 
 		 162 aa  197  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2246  rRNA large subunit methyltransferase  66.05 
 
 		 165 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.37412  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0416  rRNA large subunit methyltransferase  58.13 
 
 		 160 aa  167  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0162  rRNA large subunit methyltransferase  58.13 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0523  rRNA large subunit methyltransferase  55.9 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.238061  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0256  rRNA large subunit methyltransferase  58.13 
 
 		 160 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  56.88 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0447  rRNA large subunit methyltransferase  56.52 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399021  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  53.75 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3453  rRNA large subunit methyltransferase  53.12 
 
 		 159 aa  157  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2061  rRNA large subunit methyltransferase  58.75 
 
 		 160 aa  153  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0568  rRNA large subunit methyltransferase  56.88 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  51.25 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  51.88 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  47.5 
 
 		 170 aa  148  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  48.75 
 
 		 160 aa  148  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  50.62 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1773  rRNA large subunit methyltransferase  49.7 
 
 		 169 aa  144  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  52.5 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_004310  BR1840  rRNA large subunit methyltransferase  48.28 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2517  rRNA large subunit methyltransferase  49.38 
 
 		 155 aa  137  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  45 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  43.75 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  48.12 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  42.5 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  48.75 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2794  hypothetical protein  46.25 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  46.25 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  45.62 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1235  hypothetical protein  45.62 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  43.2 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2545  hypothetical protein  40.62 
 
 		 140 aa  99.8  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146464  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4722  rRNA large subunit methyltransferase  44.38 
 
 		 154 aa  99  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  44.63 
 
 		 135 aa  99  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  39.76 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  47.06 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  46.61 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  46.61 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  46.61 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  37.95 
 
 		 156 aa  94.4  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  37.35 
 
 		 156 aa  94.4  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  46.61 
 
 		 156 aa  94.4  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  45.76 
 
 		 156 aa  94.4  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  45.38 
 
 		 156 aa  92.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  44.92 
 
 		 156 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  40.88 
 
 		 158 aa  90.9  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  42.86 
 
 		 152 aa  90.5  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  41.61 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  38.32 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  38.32 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  38.32 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  38.32 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  38.32 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  37.13 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  38.32 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  38.32 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  31.95 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  42.37 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  42.37 
 
 		 156 aa  87.8  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0378  hypothetical protein  40.14 
 
 		 137 aa  87.4  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  35.37 
 
 		 155 aa  87.4  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  39.23 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  28.31 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3525  rRNA large subunit methyltransferase  34.55 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144296  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1973  rRNA large subunit methyltransferase  38.18 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  42.37 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  38.46 
 
 		 145 aa  84.7  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2624  rRNA large subunit methyltransferase  48.94 
 
 		 155 aa  84.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0866518  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  40.5 
 
 		 156 aa  84  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  48.31 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  42.74 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  47.87 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  40.37 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  35.58 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  42.74 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  35.37 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  26.51 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0057  hypothetical protein  36.25 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  27.71 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1902  rRNA large subunit methyltransferase  46.81 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0816634  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  38.46 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  33.54 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  40.12 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2080  rRNA large subunit methyltransferase  36.14 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  37.89 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  42.16 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  36.36 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  45.74 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1733  rRNA large subunit methyltransferase  35.76 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  35.85 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  31.43 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  29.09 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000386318  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  29.17 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  44.64 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  30.25 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  44.14 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>