48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0092 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  68.37 
 
 		 215 aa  255  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  59.91 
 
 		 225 aa  242  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  56.42 
 
 		 224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  55.96 
 
 		 249 aa  210  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  54.13 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  36.32 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  42.99 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  37.23 
 
 		 658 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  36.28 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  37.75 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  38.46 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  37.75 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  37.14 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  37.24 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  39.77 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  36.23 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  30.92 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  35.41 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  37.32 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  36.84 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  36.36 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  38.71 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  29.7 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  30.73 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  30.73 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  37.08 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  34.24 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  32.78 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  35.84 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  29.83 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  32.84 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  32.35 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  26.37 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  32.76 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  27.4 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  30.88 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  25.48 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  28.89 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  29.61 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1457  protein of unknown function DUF1275  27.62 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19360  predicted membrane protein  32 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0604968  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  34.76 
 
 		 259 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  25.68 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  34.12 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  34.12 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  27.95 
 
 		 283 aa  42  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  26.73 
 
 		 224 aa  41.6  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>