93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0081 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0081  DoxX family protein  100 
 
 		 175 aa  321  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.614954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3623  DoxX family protein  67.83 
 
 		 174 aa  176  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3428  DoxX family protein  69.7 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3737  DoxX family protein  69.7 
 
 		 175 aa  175  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2136  DoxX family protein  62.41 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1107  DoxX family protein  61.47 
 
 		 168 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298421  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  36.51 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  33.82 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  32 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  30.33 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  37.88 
 
 		 136 aa  62  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  32.62 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  29.6 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  33.86 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  33.86 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  34.09 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  32.82 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  32.35 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  29.69 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  32.59 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  30.15 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  31.72 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  28.57 
 
 		 143 aa  51.2  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  35.64 
 
 		 315 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  26.36 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  29.46 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  33.33 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  30.16 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  34.68 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  31.82 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  33.03 
 
 		 137 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  31.97 
 
 		 276 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  31.01 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  31.01 
 
 		 161 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  31.01 
 
 		 161 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  31.01 
 
 		 161 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  28.91 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  29.6 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  28.68 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  31.01 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  28.91 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  30.63 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  28.68 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2564  DoxX family protein  32.46 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  28.91 
 
 		 130 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  28.37 
 
 		 131 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  28.37 
 
 		 131 aa  45.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  28.37 
 
 		 131 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  27.82 
 
 		 146 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  27.62 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  28.93 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  25.58 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  25.4 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  28.91 
 
 		 130 aa  45.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  26.67 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  26.67 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  30 
 
 		 143 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3474  DoxX family protein  32.31 
 
 		 132 aa  44.7  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418038 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  28.24 
 
 		 128 aa  44.7  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  28.12 
 
 		 130 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  28.12 
 
 		 130 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  28.12 
 
 		 130 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  28.12 
 
 		 130 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  28.12 
 
 		 130 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  34.33 
 
 		 136 aa  44.7  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  34.29 
 
 		 321 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  34.29 
 
 		 321 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  34.29 
 
 		 321 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  26.67 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  26.32 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  26.67 
 
 		 140 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  26.67 
 
 		 140 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  26.67 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  26.67 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  26.67 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  29.84 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  32.38 
 
 		 119 aa  42.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  32.23 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  37.08 
 
 		 149 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  32.59 
 
 		 140 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  25.93 
 
 		 136 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1932  DoxX family protein  35.16 
 
 		 137 aa  42.4  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.486729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  28 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2902  DoxX family protein  32.58 
 
 		 142 aa  42  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0568871  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1351  DoxX family protein  32.38 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0214907  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  28.68 
 
 		 174 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1387  hypothetical protein  27.27 
 
 		 128 aa  41.6  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2591  DoxD-like family protein  32.38 
 
 		 167 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  26.72 
 
 		 138 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  26.92 
 
 		 137 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1436  DoxX family protein  31.43 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.921466  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  29.2 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  29.25 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>