34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0074 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  100 
 
 
592 aa  1163    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4284  conserved hypothetical proteinn  57.08 
 
 
597 aa  529  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3898  hypothetical protein  55.9 
 
 
647 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242852  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3606  hypothetical protein  56.48 
 
 
646 aa  505  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  46.86 
 
 
528 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  46.56 
 
 
546 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  35.81 
 
 
571 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  35.31 
 
 
566 aa  229  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1361  hypothetical protein  34.65 
 
 
568 aa  223  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515582  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0865  hypothetical protein  36.11 
 
 
564 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  36.96 
 
 
563 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4538  hypothetical protein  36.57 
 
 
540 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0932  hypothetical protein  33.42 
 
 
563 aa  200  7.999999999999999e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0523701  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  32.61 
 
 
617 aa  197  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  28.02 
 
 
552 aa  151  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  28.53 
 
 
590 aa  148  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  31.17 
 
 
423 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2738  hypothetical protein  28.79 
 
 
515 aa  140  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.22803  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0072  hypothetical protein  27.32 
 
 
512 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387574  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0067  hypothetical protein  27.25 
 
 
502 aa  138  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4270  hypothetical protein  27.08 
 
 
528 aa  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  27.08 
 
 
537 aa  124  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3610  hypothetical protein  26.84 
 
 
513 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  27 
 
 
424 aa  115  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3308  hypothetical protein  26.27 
 
 
511 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  26.48 
 
 
420 aa  103  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  24.34 
 
 
451 aa  103  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2706  hypothetical protein  26.04 
 
 
467 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3723  hypothetical protein  30.7 
 
 
505 aa  98.6  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  25.43 
 
 
400 aa  80.1  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0809  hypothetical protein  20.64 
 
 
394 aa  57.8  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1174  hypothetical protein  24.22 
 
 
477 aa  55.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.605378  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0735  hypothetical protein  22.96 
 
 
437 aa  53.5  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0886223  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2813  hypothetical protein  23.17 
 
 
386 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>