73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0071 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  100 
 
 
63 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  72.13 
 
 
67 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  73.02 
 
 
67 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  72.13 
 
 
67 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  73.02 
 
 
67 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  69.84 
 
 
67 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  66.67 
 
 
67 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  68.85 
 
 
67 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  69.35 
 
 
71 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  66.67 
 
 
71 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  68.25 
 
 
67 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  68.25 
 
 
67 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  66.13 
 
 
71 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  67.21 
 
 
67 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  62.3 
 
 
71 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  65.08 
 
 
71 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2997  CsbD-like protein  71.7 
 
 
71 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  61.29 
 
 
63 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  64.91 
 
 
59 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  66.67 
 
 
59 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  66.67 
 
 
59 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  58.73 
 
 
63 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  64.91 
 
 
59 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1079  CsbD-like  68 
 
 
71 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0315456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  59.68 
 
 
63 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  58.93 
 
 
59 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  50 
 
 
63 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  49.21 
 
 
63 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0658  CsbD family protein  47.62 
 
 
63 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1434  CsbD-like protein  50 
 
 
60 aa  50.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  50 
 
 
57 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  42.86 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5651  CsbD family protein  42.62 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  46.55 
 
 
61 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  48.08 
 
 
57 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  46.15 
 
 
57 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  46.15 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  45.61 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  40.35 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  46.15 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1332  CsbD-like  48.21 
 
 
60 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00134797  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  50 
 
 
55 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  46.15 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  44.23 
 
 
57 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  38.98 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  42.11 
 
 
59 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  43.86 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0545  hypothetical protein  50.88 
 
 
59 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  40.35 
 
 
62 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  40.68 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3862  CsbD family protein  47.83 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  40.68 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  39.66 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  38.98 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  37.29 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  42.31 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  38.46 
 
 
58 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  36.84 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1353  CsbD family protein  43.86 
 
 
71 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43261e-22 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  42.37 
 
 
63 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  43.1 
 
 
61 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  40.74 
 
 
114 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2861  CsbD family protein  41.67 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  36.21 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  40.38 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1221  hypothetical protein  44.26 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000483184  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  35.59 
 
 
60 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  40 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  37.5 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  37.29 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  44.64 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  42.59 
 
 
72 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  41.82 
 
 
59 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>