More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0050 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 306 aa  593  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  74.15 
 
 		 308 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  72.3 
 
 		 298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  72.7 
 
 		 294 aa  401  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  74.15 
 
 		 297 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6780  histone deacetylase superfamily  71.67 
 
 		 298 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2562  Histone deacetylase  49.83 
 
 		 305 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3551  histone deacetylase superfamily  49.49 
 
 		 305 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4892  histone deacetylase superfamily protein  55.44 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3915  histone deacetylase superfamily protein  52.46 
 
 		 315 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  47.46 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3192  histone deacetylase superfamily protein  46.92 
 
 		 305 aa  269  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00911775  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1827  histone deacetylase superfamily protein  45.7 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10030  histone deacetylase superfamily  50.51 
 
 		 316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1393  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein-like  48.29 
 
 		 304 aa  265  5.999999999999999e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.194758  normal  0.700999 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1764  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  51.33 
 
 		 316 aa  265  7e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0823367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2706  histone deacetylase superfamily  46.44 
 
 		 305 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000210159  unclonable  0.000000000120446 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1459  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  48.33 
 
 		 305 aa  265  8.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2905  histone deacetylase superfamily protein  44.52 
 
 		 308 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.681424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4295  histone deacetylase superfamily protein  47.8 
 
 		 305 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4918  histone deacetylase superfamily protein  46.92 
 
 		 306 aa  256  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000273279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0656  histone deacetylase superfamily protein  47.96 
 
 		 304 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000855576  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3722  histone deacetylase superfamily protein  48.49 
 
 		 306 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4662  histone deacetylase family protein  47.8 
 
 		 305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4764  histone deacetylase superfamily  46.26 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000188722  decreased coverage  0.000868257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4639  histone deacetylase superfamily protein  46.26 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000315852  hitchhiker  0.00689363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4777  histone deacetylase superfamily protein  46.26 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000599986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1152  histone deacetylase superfamily protein  48.01 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0905584  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1245  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  44.71 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118499 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1991  histone deacetylase superfamily protein  48.97 
 
 		 318 aa  242  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2377  histone deacetylase superfamily protein  47.65 
 
 		 300 aa  241  9e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.018  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1601  histone deacetylase superfamily  48.43 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2162  histone deacetylase superfamily protein  42.56 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3373  histone deacetylase family protein  40 
 
 		 300 aa  235  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0543734  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1201  histone deacetylase superfamily protein  47.87 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329608  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1507  hypothetical protein  49.29 
 
 		 324 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000688301  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0323  deacetylase  40.83 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1815  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  41.64 
 
 		 304 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04120  Histone deacetylase superfamily protein  40.48 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1529  histone deacetylase superfamily protein  44.57 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.188503  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2474  histone deacetylase superfamily protein  41.64 
 
 		 300 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2542  histone deacetylase superfamily protein  40.96 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  43.01 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2660  histone deacetylase superfamily protein  40.66 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2487  histone deacetylase superfamily protein  41.3 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.60651  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2634  histone deacetylase superfamily protein  40.2 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40681  predicted protein  44.71 
 
 		 323 aa  221  8e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000252385  normal  0.188986 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2634  histone deacetylase superfamily protein  41.3 
 
 		 300 aa  222  8e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1768  Histone deacetylase  47.79 
 
 		 311 aa  221  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1606  hypothetical protein  48.78 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000378797  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2483  Histone deacetylase  40.96 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  0.140117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3448  histone deacetylase superfamily protein  45.96 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.509704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1584  histone deacetylase superfamily protein  44.93 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2066  deacetylase  44.48 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.288592  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1420  histone deacetylase superfamily protein  45.95 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0496164 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2116  histone deacetylase superfamily protein  39.79 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1614  histone deacetylase superfamily protein  39.25 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1648  histone deacetylase superfamily protein  39.25 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1625  histone deacetylase superfamily protein  39.59 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002921  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.64 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1393  histone deacetylase superfamily  42.03 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2043  Histone deacetylase  40 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0169314  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1629  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.6 
 
 		 306 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3087  histone deacetylase superfamily protein  44.88 
 
 		 337 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000151146  normal  0.0282587 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6866  histone deacetylase superfamily  38.23 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.859971  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1941  histone deacetylase superfamily  44.98 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00172119  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3500  Histone deacetylase  44.33 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03035  hypothetical protein  38.93 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4821  predicted protein  42.37 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2729  histone deacetylase superfamily  38.57 
 
 		 302 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3900  histone deacetylase superfamily protein  37.79 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1162  histone deacetylase superfamily protein  39.73 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1613  histone deacetylase superfamily protein  45.77 
 
 		 333 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000152208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1613  histone deacetylase superfamily  44.12 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000964161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3030  Histone deacetylase  42.48 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3902  histone deacetylase superfamily protein  37.5 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000251706  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2469  Histone deacetylase  47.81 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40492  predicted protein  40.21 
 
 		 350 aa  190  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0423597 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2506  histone deacetylase superfamily  43.94 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02968  histone deacetylase family protein  45.41 
 
 		 224 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510136  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9278  predicted protein  40.14 
 
 		 294 aa  185  8e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0998  hypothetical protein  35.03 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  33.02 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  35.34 
 
 		 393 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  35.66 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  36.14 
 
 		 394 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  36.3 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  31.88 
 
 		 385 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  33.65 
 
 		 378 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  32.2 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  33.75 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  37.65 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  32.51 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  35.27 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 		 407 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  37.07 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  34.17 
 
 		 370 aa  105  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  31.54 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  29.89 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  31.21 
 
 		 385 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>