18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0030 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0030  protein CoxF  100 
 
 		 54 aa  107  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148285  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3456  conserved protein CoxF  70.37 
 
 		 54 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3584  protein CoxF  68.52 
 
 		 54 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3260  protein CoxF  68.52 
 
 		 54 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0263  protein CoxF  70.45 
 
 		 50 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120067  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0727  protein CoxF  59.09 
 
 		 55 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0764  CoxF protein  61.36 
 
 		 56 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0226  CoxF protein  61.36 
 
 		 56 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0902  CoxF protein  59.09 
 
 		 55 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0674992  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3460  CoxF protein  59.09 
 
 		 54 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548506  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0258  CoxF protein  59.09 
 
 		 54 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962663  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0672  hypothetical protein  53.49 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482572 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4790  putative CoxF  52.94 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2346  protein CoxF  68.18 
 
 		 50 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1240  hypothetical protein  62.79 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.498163 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0744  hypothetical protein  53.66 
 
 		 52 aa  42.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0200822  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0584  hypothetical protein  41.51 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000268362  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0605  hypothetical protein  45 
 
 		 46 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>