133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0026 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  100 
 
 		 254 aa  507  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  70.97 
 
 		 253 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  71.19 
 
 		 253 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  67.32 
 
 		 256 aa  332  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  66.53 
 
 		 256 aa  328  7e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  66.53 
 
 		 256 aa  325  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  48.47 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  47.22 
 
 		 260 aa  184  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  44.5 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  44.39 
 
 		 252 aa  178  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  44.2 
 
 		 251 aa  178  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  46.88 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  44.39 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  44.34 
 
 		 253 aa  171  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  48.29 
 
 		 287 aa  168  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  39.92 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  43.1 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  43.23 
 
 		 278 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  44.44 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  39.57 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  45.45 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  40 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  43.4 
 
 		 229 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  41.1 
 
 		 233 aa  158  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  43.18 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  42.86 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  40.56 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  42.11 
 
 		 249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  42.11 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  43.12 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  45.71 
 
 		 231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  40.62 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  38.84 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  39.09 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  38.53 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  38.05 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  31.42 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  37.71 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  36.05 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  39.5 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  36.52 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  42.18 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  35.62 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  34.52 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2219  Surfeit locus 1 family protein  35.83 
 
 		 282 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127472  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  35.46 
 
 		 269 aa  122  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  36.25 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  35.06 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  35.74 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  37.29 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  35.32 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  35.32 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  30.68 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  31.36 
 
 		 324 aa  105  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  35.54 
 
 		 233 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0835  putative surfeit 1 protein  30.7 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  33.91 
 
 		 223 aa  99.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  31.2 
 
 		 238 aa  99  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  29.18 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00150  mitochondrial protein required for respiration, putative  31.23 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303199  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  28.81 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  29.87 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  29.13 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  30.71 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  29.44 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  28.7 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  29.44 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  28.7 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  29.87 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  29.46 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  30.7 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  27.75 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.71 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4499  SurF1 family protein  26.36 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_002978  WD1248  hypothetical protein  26.34 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  27.83 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1081  SURF1 family protein  26.79 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.5204  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  27.93 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  27.93 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  27.93 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  27.4 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  27.93 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  30.25 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  31.73 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  28.75 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0869  hypothetical protein  26.64 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3882  hypothetical protein  29.61 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  28.46 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  33.62 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  28.16 
 
 		 333 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  29.02 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  27.73 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2227  SURF1 family protein  28.45 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.752396  normal  0.0142027 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  28.94 
 
 		 303 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  27.07 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  26.32 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  31.14 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  26.61 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  42.86 
 
 		 265 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  33.81 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>