24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0012 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0012  major facilitator transporter  100 
 
 		 430 aa  815    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0411083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0025  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 445 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00511907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  36.94 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  25.27 
 
 		 409 aa  53.5  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 413 aa  53.9  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  33.1 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 418 aa  49.7  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 416 aa  49.7  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1821  transporter  31.43 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  24.81 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0886  RhtX/FptX family siderophore transporter  32.14 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0796  RhtX/FptX family siderophore transporter  32.14 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2158  hypothetical protein  32.14 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  34.51 
 
 		 414 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0880  putative transporter  33.1 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 388 aa  44.3  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 396 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>