More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0002 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0002  chromosomal replication initiation protein  80.91 
 
 
501 aa  796  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0001  chromosomal replication initiation protein  80.91 
 
 
501 aa  796  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0002  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
498 aa  989  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0001  chromosomal replication initiation protein  79.12 
 
 
494 aa  746  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.852723  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0001  chromosomal replication initiation protein  77.69 
 
 
499 aa  721  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00640124  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0002  chromosomal replication initiation protein  83.64 
 
 
501 aa  795  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0001  chromosomal replication initiation protein  61.01 
 
 
473 aa  573  1e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0003  chromosomal replication initiation protein  60.04 
 
 
510 aa  573  1e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  2.44231e-08  normal  0.247706 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0001  chromosomal replication initiation protein  60.75 
 
 
475 aa  572  1e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0001  chromosomal replication initiation protein  60.04 
 
 
472 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0001  chromosomal replication initiation protein  60.63 
 
 
472 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0001  chromosomal replication initiation protein  60.16 
 
 
506 aa  561  1e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0001  chromosomal replication initiation protein  59.83 
 
 
475 aa  559  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0001  chromosomal replication initiation protein  60.08 
 
 
472 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0001  chromosomal replication initiation protein  61.47 
 
 
475 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0001  chromosomal replication initiation protein  52 
 
 
506 aa  501  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0129481  hitchhiker  1.43408e-08 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0001  chromosomal replication initiation protein  49.8 
 
 
516 aa  446  1e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0192779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0001  chromosomal replication initiation protein  48.54 
 
 
479 aa  446  1e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0301114  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0001  chromosomal replication initiation protein  50.52 
 
 
516 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962631  hitchhiker  0.00495499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0391  chromosomal replication initiation protein  47.93 
 
 
524 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246214  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0002  chromosomal replication initiation protein  49.69 
 
 
481 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480088  hitchhiker  1.32312e-05 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1279  chromosomal replication initiation protein  47.16 
 
 
524 aa  412  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  5.04678e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0003  chromosomal replication initiation protein  46.8 
 
 
520 aa  411  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  2.73847e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.48 
 
 
519 aa  407  1e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  1.18183e-08  unclonable  1.22456e-24 
 
 
-
 
NC_004310  BR0001  chromosomal replication initiation protein  45.27 
 
 
496 aa  408  1e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00276825  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0001  chromosomal replication initiation protein  45.27 
 
 
496 aa  408  1e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  8.69739e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  41.77 
 
 
448 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0001  chromosomal replication initiation protein  42.27 
 
 
509 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  40.79 
 
 
470 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  42.06 
 
 
461 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  6.03983e-07 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  38.35 
 
 
452 aa  363  5e-99  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  40.97 
 
 
460 aa  360  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0809  chromosomal replication initiation protein  38.75 
 
 
464 aa  359  5e-98  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54082  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.92 
 
 
477 aa  358  1e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  42.18 
 
 
455 aa  358  2e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  42.18 
 
 
455 aa  358  2e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  40.9 
 
 
482 aa  355  9e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0001  chromosomal replication initiation protein  38.25 
 
 
460 aa  355  1e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.335135  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  38.55 
 
 
477 aa  353  3e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0001  chromosomal replication initiation protein  37.91 
 
 
475 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.75 
 
 
482 aa  329  7e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  4.60391e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0259  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.14 
 
 
474 aa  325  9e-88  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0001  chromosomal replication initiation protein  41.61 
 
 
498 aa  317  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.89 
 
 
453 aa  315  9e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  38.57 
 
 
451 aa  314  2e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  7.64641e-07  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  40.13 
 
 
463 aa  313  4e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.17775e-05  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  39.92 
 
 
462 aa  312  8e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.10804e-08  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  39.92 
 
 
462 aa  312  8e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  35.44 
 
 
446 aa  310  4e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  36.21 
 
 
453 aa  308  1e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.48 
 
 
462 aa  308  1e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  36.21 
 
 
453 aa  308  1e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  38.6 
 
 
467 aa  308  1e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  5.58594e-06  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  38.6 
 
 
467 aa  308  2e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.26813e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  38.6 
 
 
467 aa  308  2e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.01887e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  38.6 
 
 
467 aa  308  2e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.02031e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  34.81 
 
 
446 aa  308  2e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  39.26 
 
 
466 aa  308  2e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  34.81 
 
 
446 aa  308  2e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  38.6 
 
 
467 aa  308  2e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  34.81 
 
 
446 aa  308  2e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  34.81 
 
 
446 aa  308  2e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  34.81 
 
 
446 aa  308  2e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  38.6 
 
 
467 aa  308  2e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  34.81 
 
 
446 aa  308  2e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  34.81 
 
 
446 aa  308  2e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  39.26 
 
 
466 aa  308  2e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.6 
 
 
467 aa  308  2e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.36922e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.46 
 
 
464 aa  308  2e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  39.26 
 
 
466 aa  308  2e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  39.26 
 
 
466 aa  308  2e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.44177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  38.6 
 
 
467 aa  307  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  38.6 
 
 
467 aa  307  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  6.6194e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  34.18 
 
 
446 aa  307  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  38.07 
 
 
466 aa  306  8e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  39.83 
 
 
450 aa  305  1e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  6.34969e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.6 
 
 
483 aa  305  1e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  3.28329e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  35.23 
 
 
446 aa  305  1e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  38.97 
 
 
468 aa  304  2e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  39.27 
 
 
465 aa  305  2e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  38.59 
 
 
465 aa  304  2e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.45 
 
 
442 aa  303  3e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0001  chromosomal replication initiation protein  39.56 
 
 
487 aa  303  4e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.775334  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  34.18 
 
 
450 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  37.03 
 
 
452 aa  301  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  34.18 
 
 
446 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  37.03 
 
 
452 aa  301  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  34.39 
 
 
450 aa  301  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  34.58 
 
 
436 aa  299  8e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  38.49 
 
 
462 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.81438e-07  unclonable  1.18337e-08 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  43.07 
 
 
451 aa  297  2e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  38.03 
 
 
461 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.02323e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  38.25 
 
 
472 aa  298  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.51721e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  33.89 
 
 
457 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  38.49 
 
 
449 aa  297  3e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  33.89 
 
 
457 aa  297  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.29 
 
 
449 aa  296  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.41272e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  38.2 
 
 
462 aa  296  5e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  4.03403e-07  unclonable  1.36332e-10 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  37.92 
 
 
460 aa  296  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  38.46 
 
 
455 aa  296  5e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>