More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5428 on replicon NC_010727
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010727  Mpop_5428  integration host factor, beta subunit  100 
 
 		 94 aa  190  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2501  integration host factor, beta subunit  72.53 
 
 		 106 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2198  integration host factor, beta subunit  72.53 
 
 		 106 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2444  integration host factor, beta subunit  71.43 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  69.23 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  69.23 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0204  integration host factor, beta subunit  68.13 
 
 		 102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0395  integration host factor subunit beta  65.96 
 
 		 101 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0144  integration host factor, beta subunit  65.22 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0638  integration host factor subunit beta  65.96 
 
 		 101 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0101  integration host factor subunit beta  67.03 
 
 		 103 aa  130  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0069  integration host factor subunit beta  64.89 
 
 		 104 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0203936  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  67.03 
 
 		 95 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0058  integration host factor subunit beta  65.93 
 
 		 101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0950435  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0194  integration host factor subunit beta  65.59 
 
 		 101 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  63.83 
 
 		 101 aa  128  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2928  integration host factor, beta subunit  65.22 
 
 		 97 aa  127  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2219  integration host factor subunit beta  64.84 
 
 		 94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0365391  normal  0.362428 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  71.26 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  64.13 
 
 		 110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  66.67 
 
 		 100 aa  124  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  63.74 
 
 		 95 aa  124  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  63.74 
 
 		 95 aa  123  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  61.54 
 
 		 95 aa  117  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  60.87 
 
 		 98 aa  117  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  60.44 
 
 		 94 aa  116  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0021  integration host factor subunit beta  60.44 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1371  integration host factor subunit beta  60.44 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  61.54 
 
 		 93 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  61.54 
 
 		 93 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  61.54 
 
 		 93 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0059  integration host factor subunit beta  60.44 
 
 		 99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0409  integration host factor subunit beta  60.44 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0043  integration host factor subunit beta  60.44 
 
 		 99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.621323  normal  0.262305 
 
 
-
 
NC_004310  BR0153  integration host factor subunit beta  58.24 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0148  integration host factor subunit beta  58.24 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395454  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0165  integration host factor subunit beta  58.24 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6405  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6375  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0104  integration host factor subunit beta  61.54 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2409  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02859  integration host factor subunit beta  54.02 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1329  integration host factor, beta subunit  47.31 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0690057  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003021  integration host factor beta subunit  54.02 
 
 		 93 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000932268  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  51.65 
 
 		 92 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  56.32 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  54.02 
 
 		 98 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1504  integration host factor subunit beta  51.72 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000278051  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  51.72 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15880  integration host factor subunit beta  51.72 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  49.43 
 
 		 95 aa  97.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3941  integration host factor subunit beta  47.31 
 
 		 98 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.21925 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2222  integration host factor subunit beta  50.57 
 
 		 93 aa  97.4  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000109165  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1365  integration host factor subunit beta  47.31 
 
 		 98 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.361598  normal  0.0158973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  47.87 
 
 		 96 aa  97.1  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1773  integration host factor subunit beta  46.24 
 
 		 100 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976325  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1855  integration host factor subunit beta  46.24 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1968  integration host factor subunit beta  47.83 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.943011  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0501  integration host factor, beta subunit  52.87 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4060  integration host factor subunit beta  46.24 
 
 		 98 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1380  integration host factor subunit beta  47.31 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2041  integration host factor subunit beta  48.28 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000705182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23340  integration host factor subunit beta  47.83 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116436  hitchhiker  0.00519002 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3223  integration host factor, beta subunit  48.28 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00795206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1978  integration host factor subunit beta  48.28 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000261968  unclonable  0.000000000047672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2401  integration host factor subunit beta  48.28 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1751  integration host factor, beta subunit  45.16 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162553  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2071  integration host factor subunit beta  48.28 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2278  integration host factor subunit beta  48.28 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000837765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2395  integration host factor subunit beta  48.28 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000343473  unclonable  0.00000762549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3641  integration host factor subunit beta  45.16 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222556  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  51.72 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2074  integration host factor subunit beta  49.43 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000549511  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2152  integration host factor, beta subunit  52.87 
 
 		 98 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0462696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0262  integration host factor beta-subunit  47.83 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1925  integration host factor subunit beta  48.28 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000515528  unclonable  0.0000000000266845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2053  integration host factor subunit beta  48.28 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000159286  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2067  integration host factor subunit beta  48.28 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000478736  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2122  integration host factor subunit beta  48.28 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000593472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  46.74 
 
 		 98 aa  94.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1955  integration host factor subunit beta  48.28 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000468135  unclonable  0.00000320833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  51.72 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1931  integration host factor, beta subunit  47.83 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  50.57 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1596  integration host factor subunit beta  49.43 
 
 		 111 aa  94.4  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.878202  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1737  integration host factor subunit beta  48.28 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122677  hitchhiker  0.00231326 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1539  integration host factor subunit beta  49.43 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1754  integration host factor subunit beta  47.13 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00916  integration host factor subunit beta  49.43 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2731  integration host factor, beta subunit  49.43 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00160452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1009  integration host factor subunit beta  49.43 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000570398  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1073  integration host factor subunit beta  49.43 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0306564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1018  integration host factor subunit beta  49.43 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000522422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2208  integration host factor subunit beta  49.43 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000105854  normal  0.266842 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2465  integration host factor subunit beta  44.09 
 
 		 96 aa  93.6  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00923  hypothetical protein  49.43 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.294308  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2416  integration host factor subunit beta  49.43 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000431379  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2684  integration host factor subunit beta  49.43 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193078  normal  0.358809 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1431  integration host factor subunit beta  49.43 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0064808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1307  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.226884  hitchhiker  0.000000648768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>