240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5422 on replicon NC_010727
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  100 
 
 
250 aa  516  1e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  100 
 
 
250 aa  516  1e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  81.6 
 
 
250 aa  439  1e-122  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  80.4 
 
 
250 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  79.92 
 
 
250 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  79.6 
 
 
250 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  77.6 
 
 
250 aa  421  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  78.8 
 
 
250 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  78.4 
 
 
246 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  77.6 
 
 
250 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  81.28 
 
 
346 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  75.5 
 
 
259 aa  405  1e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  72.8 
 
 
346 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  72.8 
 
 
250 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  71.6 
 
 
250 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  79.05 
 
 
224 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7154  transposase  66.53 
 
 
224 aa  350  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  79 
 
 
319 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  79.6 
 
 
227 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  65.2 
 
 
234 aa  327  9e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  47.21 
 
 
255 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  49.76 
 
 
218 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  47.23 
 
 
254 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  47.23 
 
 
254 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  47.23 
 
 
264 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  48.1 
 
 
238 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  45.62 
 
 
302 aa  182  6e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  46.86 
 
 
235 aa  180  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  40.17 
 
 
235 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  45.89 
 
 
235 aa  177  2e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  40.17 
 
 
235 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  39.74 
 
 
235 aa  174  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  40.17 
 
 
235 aa  174  1e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  41.46 
 
 
222 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  44.71 
 
 
240 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  44.71 
 
 
240 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  44.71 
 
 
240 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  44.71 
 
 
240 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  44.71 
 
 
240 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  44.71 
 
 
240 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  44.71 
 
 
240 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  44.71 
 
 
240 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  44.71 
 
 
240 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  44.71 
 
 
240 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  44.71 
 
 
240 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  44.71 
 
 
240 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  44.71 
 
 
240 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  44.71 
 
 
234 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  43.27 
 
 
235 aa  167  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  41.95 
 
 
243 aa  166  3e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  43 
 
 
235 aa  164  1e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  43.75 
 
 
236 aa  163  2e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  40.95 
 
 
228 aa  162  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  39.91 
 
 
228 aa  160  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  39.91 
 
 
228 aa  160  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  42.5 
 
 
238 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  42.29 
 
 
238 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  43.08 
 
 
212 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  40.95 
 
 
227 aa  158  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  41.12 
 
 
228 aa  158  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  42.56 
 
 
215 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  40 
 
 
230 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  6.73893e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40 
 
 
230 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.09545e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40 
 
 
230 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  40 
 
 
230 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.04677e-06  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  42.44 
 
 
263 aa  152  3e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  42.29 
 
 
341 aa  151  9e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  43.02 
 
 
185 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  43.02 
 
 
185 aa  149  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  35.27 
 
 
246 aa  148  1e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  41.62 
 
 
206 aa  146  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  48.59 
 
 
181 aa  144  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  37.24 
 
 
198 aa  143  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  38.74 
 
 
236 aa  139  4e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  40.1 
 
 
237 aa  138  8e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  37.88 
 
 
202 aa  138  9e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  35.37 
 
 
226 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  39.61 
 
 
236 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  41.33 
 
 
213 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  34.93 
 
 
226 aa  136  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  35.81 
 
 
226 aa  135  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  37.69 
 
 
226 aa  135  5e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  35.37 
 
 
226 aa  135  6e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  34.93 
 
 
226 aa  135  7e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  40.61 
 
 
213 aa  135  7e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  36.32 
 
 
224 aa  135  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  36.32 
 
 
224 aa  135  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  36.32 
 
 
224 aa  135  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  36.32 
 
 
224 aa  135  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>