More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5232 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5232  aldo/keto reductase  100 
 
 
292 aa  589  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109633  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4689  aldo/keto reductase  93.84 
 
 
292 aa  555  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5154  aldo/keto reductase  93.49 
 
 
292 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0536  aldo/keto reductase  79.38 
 
 
291 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2084  aldo/keto reductase  71.28 
 
 
295 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0764  aldo/keto reductase  65.12 
 
 
288 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0414529 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1685  aldo/keto reductase  65.25 
 
 
300 aa  372  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0104  aldo/keto reductase  62.11 
 
 
293 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0114  aldo/keto reductase  61.4 
 
 
293 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3009  aldo/keto reductase  62.23 
 
 
285 aa  350  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0466908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  62.37 
 
 
289 aa  349  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2941  aldo/keto reductase  60.99 
 
 
284 aa  338  5e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4269  aldo/keto reductase  61.19 
 
 
287 aa  338  9e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207462  normal  0.521186 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3551  aldo/keto reductase  57.24 
 
 
300 aa  333  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5322  aldo/keto reductase  59.93 
 
 
293 aa  328  8e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0362532 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2191  aldo/keto reductase  58.78 
 
 
296 aa  322  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.41887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2253  aldo/keto reductase  54.77 
 
 
286 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0329  aldo/keto reductase  56.83 
 
 
280 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0446  aldo/keto reductase  57.3 
 
 
283 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00031204  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2555  aldo/keto reductase  56.83 
 
 
289 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1373  aldo/keto reductase  56.23 
 
 
284 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5317  aldo/keto reductase  56.57 
 
 
279 aa  305  6e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2291  aldo/keto reductase  56.67 
 
 
293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3682  aldo/keto reductase  54.96 
 
 
290 aa  302  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1564  aldo/keto reductase  57.14 
 
 
335 aa  301  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3405  aldo/keto reductase  53.57 
 
 
304 aa  296  4e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3653  aldo/keto reductase  53.21 
 
 
290 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2292  aldo/keto reductase  52.22 
 
 
293 aa  280  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6541  aldo/keto reductase  51.82 
 
 
288 aa  277  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7191  aldo/keto reductase  48.23 
 
 
281 aa  265  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.633848  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0263  aldo/keto reductase  50 
 
 
281 aa  265  8e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.00520764 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1525  aldo/keto reductase  50 
 
 
287 aa  261  6.999999999999999e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.135772  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1321  aldo/keto reductase  51.27 
 
 
287 aa  258  6e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1388  aldo/keto reductase  47.1 
 
 
286 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0449  aldo/keto reductase  49.82 
 
 
300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4547  aldo/keto reductase  52 
 
 
278 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.877781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4399  aldo/keto reductase  52.71 
 
 
285 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278504  hitchhiker  0.00297654 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0510  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  42.76 
 
 
292 aa  230  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.372806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5228  aldo/keto reductase  48.36 
 
 
281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19120  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  45.21 
 
 
310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121634  normal  0.418593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5769  putative oxidoreductase  44.01 
 
 
311 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6037  aldo/keto reductase  43.21 
 
 
293 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2112  putative oxidoreductase  41.87 
 
 
288 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0010  putative oxidoreductase  41.24 
 
 
300 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737964  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6534  putative oxidoreductase  41.18 
 
 
315 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.35079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1976  putative oxidoreductase  41.46 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0299  putative oxidoreductase  40.28 
 
 
292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876534  normal  0.304239 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5911  putative oxidoreductase  40.83 
 
 
292 aa  198  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360934  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3184  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.24 
 
 
287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.11057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1859  putative oxidoreductase  40.21 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6751  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
275 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0889  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0531022 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4576  putative oxidoreductase  41.3 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25594  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2776  putative oxidoreductase  42.31 
 
 
292 aa  195  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1340  aldo/keto reductase  42.18 
 
 
293 aa  195  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.266223  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3775  putative oxidoreductase  40.07 
 
 
294 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4852  putative oxidoreductase  40.07 
 
 
294 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2239  aldo/keto reductase  40.42 
 
 
286 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0140454  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2252  putative oxidoreductase  40.42 
 
 
286 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103537  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1135  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
294 aa  195  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1489  putative oxidoreductase  40.42 
 
 
286 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1766  putative oxidoreductase  40.42 
 
 
286 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951362 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1587  putative oxidoreductase  40.42 
 
 
286 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2727  aldo/keto reductase  41.58 
 
 
296 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00257706  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2008  putative oxidoreductase  40.07 
 
 
286 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.865157  normal  0.493035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1935  aldo/keto reductase  41.87 
 
 
289 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0134693 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6338  putative oxidoreductase  41.72 
 
 
291 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3561  putative oxidoreductase  40.97 
 
 
292 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1273  putative oxidoreductase  41.05 
 
 
292 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6342  putative oxidoreductase  41.46 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4436  aldo/keto reductase  42.38 
 
 
274 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6038  putative oxidoreductase  42.51 
 
 
291 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.796364 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2685  aldo/keto reductase  39.31 
 
 
302 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.346212  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3802  aldo/keto reductase  39.86 
 
 
293 aa  188  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3959  putative oxidoreductase  40.42 
 
 
290 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.102223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5322  aldo/keto reductase  41.49 
 
 
285 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1317  aldo/keto reductase  39.86 
 
 
290 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329831  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5411  aldo/keto reductase  41.49 
 
 
285 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5701  aldo/keto reductase  41.49 
 
 
285 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0218  aldo/keto reductase  39.86 
 
 
293 aa  185  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2833  aldo/keto reductase  39.13 
 
 
291 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0361368  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3050  putative oxidoreductase  38.46 
 
 
287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378412  normal  0.0203224 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2646  putative oxidoreductase  38.44 
 
 
293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5796  aldo/keto reductase  41.26 
 
 
294 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869077  normal  0.651023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3447  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
280 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111465  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4700  aldo/keto reductase  39.58 
 
 
297 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0809909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4872  aldo/keto reductase  38.97 
 
 
292 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4961  aldo/keto reductase  38.97 
 
 
292 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  37.38 
 
 
335 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1329  aldo/keto reductase  40.15 
 
 
291 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.398839  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5463  aldo/keto reductase  39.02 
 
 
292 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3162  aldo/keto reductase  38.79 
 
 
285 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4941  aldo/keto reductase  37.94 
 
 
322 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  35.67 
 
 
333 aa  166  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5279  putative oxidoreductase  39.73 
 
 
302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0942  aldo/keto reductase  37.5 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0303  aldo/keto reductase  37.68 
 
 
287 aa  161  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  35.43 
 
 
327 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  35.53 
 
 
327 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1743  aldo/keto reductase  34.88 
 
 
334 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>